柳生要去接替神戶海軍操練所的勝海舟，但將軍沒有去掉他的警視廳總監的位置，他只能將具體事務交給近藤勇和土方他們。
隨後，他帶著妻子輝子一起前往神戶。
此番神戶海軍操練所里有幾名學員參與了池田屋事變以及大坂之戰。
如土佐藩學員望月龜彌太就在池田屋一事中被警視廳斬殺。
另一位土佐藩學員安岡金馬則參加了長州軍在大阪與幕府的交戰，如今成了通緝犯。
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海軍操練所出現了倒幕人員，勝海舟難辭其咎。
海軍操練所內，一眾人面色戚戚，勝海舟看著垂頭喪氣的學員們，微笑道：「諸位，不用擔心，幕府只是將我解職，不會有生命危險的。」
坂本龍馬紅著眼睛，抬頭看向勝海舟：「先生，您走了，操練所何去何從，日本海軍何去何從啊！」
勝海舟苦笑一聲：「這就不是我該考慮的了，只希望新任官員知道海軍的重要性。
龍馬，別擔心，等人到了，我會親自向他舉薦你的！」
「先生！」
陸奧宗光，伊東祐亨等人紛紛抬頭看向勝海舟，眼中充滿了不舍。
這時候，近藤長次郎跑過來喊道：「先生，幕府新派官員到了！」
勝海舟聞言，立刻起身，一眾學員連忙跟上，來到了大門口。
只見大門口站著一位高大的男子，人背對著他們，看著海面，那氣勢如淵渟岳峙。
柳生聽到後面的腳步聲，轉身看過來。
坂本龍馬瞪大眼睛，隨即驚喜地喊道：「是柳生大人！您就是新的海軍奉行並！」
勝海舟也有些驚訝，他沒想到幕府居然派柳生十兵衛前來。
他當然知道此人，對於工業區，中央銀行等事情，他早有耳聞，對此他很高興。
他去過米利堅，見識過工業國家的強大，對於柳生在大阪建立工業區，他很高興地對學生們說：「這個工業區將會是日本工業的搖籃。」
只是他沒想到柳生會成為海軍奉行，畢竟柳生和海軍相關的，大概只有海關一事了。
他緩步上前道：「柳生大人，聞名不如見面，在下可是早就聽說您的事跡，請恕在下斗膽一問，您為何會成為海軍奉行並？」
柳生微微一笑：「安房守大人，此中事情太大，還是不要知道的好，對你沒有好處。」
勝海舟立馬意識到了，這其中涉及到了開國派和保守派的內部爭鬥，他暗道：這位柳生大人和自己都是一樣的，被上層排擠，只有公方大人才會支持。
他嘆了口氣：「唉，世道艱難啊，柳生大人，這海軍操練所就交給你了，有你在，幕府就不會關掉這裡，如此，日本海軍還有希望。」
柳生搖了搖頭：「安房守大人還是不要抱有太大的希望，安岡金馬和望月龜彌太都是從這裡出來的，幕府對此有了意見。
我此番前來的一個任務，就是甄別所內的學員，凡是對幕府有敵意的人員都必須離開。」
「什麼？」
不少學員臉色一僵。
他們可是從長州來的，此番長州藩與幕府在大阪開戰，他們這些人鐵定是要被遣返的。
坂本龍馬對此心知肚明，他連忙詢問：「難道就沒有別的辦法嗎？柳生大人，他們都沒有參與此事啊！」
柳生搖了搖頭：「這也是沒辦法的事情，長州藩此次出兵上洛，號稱清君側，此等大逆不道之舉，不能姑息。」
那些長州藩學員一聽，只能向勝海舟跪下行禮：「先生，這些時日多虧您的照顧了！」
勝海舟無奈地嘆了口氣：「唉，事已至此，也只能如此了。」
大家這會也都意識到了，海軍操練所再也回不到之前的日子了。
柳生看著他們，說道：「大家只要遵守幕府的規定，還是可以在這裡學習的，畢竟諸位以後都是海軍的骨幹。」
池內藏太不忿道：「我們是日本的海軍，不是幕府的海軍！」
坂本龍馬連忙攔住了池內藏太，免得他說出其他過激的話。
柳生聞言也是眉頭微皺，看起來海軍操練所內的人對幕府的觀感不太好。
不過這也難怪，幕府雖然已經開國，但機會並沒有向其他藩國的青年才俊開放。
就連幕府內，官職依舊是中高層占據最好的位置，底層依舊是大頭兵，炮灰。
現在世道大變，底層的武士都在尋求出路。
而幕府就是擋住他們道路的最大阻礙，所以他們對幕府沒有好感。
當初，坂本龍馬四處為勝海舟奔走，籌建神戶海軍私塾，就是打著日本海軍的旗號，而不是幕府海軍的旗號。
畢竟，幕府在江戶還有自己正規的海軍操練所，招收的都是旗本子弟，如榎本武楊就是如此。
柳生便只好說道：「此處歡迎大家繼續留下，如果不願意也可以自行離去。」
不少人都看向了坂本龍馬。
龍馬看向了勝海舟。
勝海舟急忙說道：「諸位，不要因為一時的困難就放棄自己的理想，實現理想的道路是曲折的，我們必須砥礪前行，才能建造強大的日本海軍！」
坂本龍馬抿了抿嘴唇，隨即笑著喊道：「不錯，先生說的對，大家絕不能輕易放棄啊！」
永持亨次郎作為勝海舟的核心弟子，卻是搖了搖頭：「先生在哪，我就在哪。」
「亨次郎！」
坂本龍馬叫了一聲。
可永持亨次郎沒有抬頭去看。
很快，有不少人站出來選擇離開海軍操練所。
柳生都一一同意了。
在他看來，幕府要培養的是自己的海軍，而不是倒幕派的海軍。
即便他知道這些人里有很多的人才。
但他是佐幕派，雙方天生就不可調和。
最終，勝海舟走了，還有一批教官和學生也離開了，留下了坂本龍馬等少數人。
其中一批學生是收到本藩的通知不得不離開的。
畢竟神戶海軍操練所內出了不少與倒幕派相關的人，這些藩擔心惹上麻煩，就把人叫回去了。
陸奧宗光等人也在被召回的名單之中。
坂本龍馬看著冷清了的海軍操練所，回憶起了往日種種，眼神中也出現了落寞。