隨著望月城的殺伐聲終於進入了本丸之中，甲賀望月家連續數代家督不斷增築、加固的城池，終究還是陷落了。
曾經，甲賀望月家家祖望月三郎兼家於平安時代的天慶三年（940年）時，追隨時任征夷大將軍藤原忠文，去追討在關東八國興兵作亂的平將門有功，受封甲賀郡境內的十六個村落，至今已有六百二十一年之久。
在甲賀五十三家之中，也就只有美濃部家一家是於延長元年（923年）成為美濃部鄉的在地領主，比甲賀望月家早了十七年的時間，這兩家在甲賀郡境內可謂是歷史悠久。
得益於望月一族擅長修養和訓練馬匹，朝廷還讓望月一族負責近江甲賀郡境內的飼養牧，這才得以快速崛起，並逐漸成為甲賀五十三家的筆頭家，甚至還不把信濃的望月總領家放在眼裡。
今時不同往日，就算甲賀望月家再擅長騎術、放牧、忍術，可一旦遇上重型佛郎機炮，再精妙的騎術與忍術都無從施展，炮彈轟來後，根本無力進行抵擋。
滿城的廝殺喧囂隔著層層倉板沉沉漫進來，火光染紅半邊天穹，城垣徹底崩破，戰局已定，再也無法依靠人力來逆轉。
望月城本丸的糧倉也成了一方孤島，遠離城中的屠戮，同時也被無邊的絕望包裹著。
偌大的糧藏里密閉幽暗，空氣中瀰漫著陳腐谷糠與淡淡硝煙混雜的澀味，四處堆壘的糧垛投下濃重陰影，唯有一處破穹漏下一線慘澹火光，堪堪照見孤身而立的望月吉棟。
望月吉棟獨自一人進入此地，遣散了身邊最後幾名側近、小姓。他知道，敵軍入城後，作為一名武家家督，唯有以死全節。
只見望月吉棟已褪去沾染血污的陣羽織，端正束好髮髻，跪坐於平整的席草之上，將太刀倚在糧堆旁，抽出腰間的脇差，指尖摩挲著冰涼的刀鞘，過往征戰、家族榮辱一一掠過心頭，最後只剩一片空茫。
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而後，望月吉棟仰頭看向一旁的窗戶，最後再望了一眼所領的土地，深吸一口氣。他周遭再無家臣、家眷，甲賀望月家基業也盡數淪喪。
為了保全武士最後的名節，望月吉棟決意在此地切腹自盡，以一腔熱血報答主家六角家的恩顧。
正當望月吉棟的指尖已然抵住腹間衣料，沉斂雙目，正要躬身落刃，沉重粗糲的撞破門扉之聲驟然炸開，老舊糧倉木門轟然崩裂，木屑飛濺。
這時，一名身著板甲的西洋騎士踏破煙塵徑直闖入，只手持一柄沉重的十字戟，靴底碾過散落穀粒，沙沙作響。兜甲只露兩道狹長眼縫，凜冽的目光死死鎖定正要赴死的望月吉棟。顯然此人並非望月城的殘兵。
望月吉棟的切腹之勢驟然凝滯，滿腔赴死的肅穆被無端驚擾，悲慟頃刻化作凜然戾氣，猛地旋身橫握脇差，腰背繃如勁竹，直面這名不請自來的異國甲士。他本欲從容了斷性命，如今卻不得不暫緩切腹來迎戰強敵。
騎士不做半句寒暄，仗著重甲護體毫無顧忌，跨步猛衝，十字戟帶著千鈞沉勢橫掃而來，鐵刃破空風聲刺耳。
終究望月吉棟身為甲賀五十三家筆頭，其身法迅疾，藉著糧垛輾轉騰挪，短刃刁鑽狠厲，專挑甲冑縫隙劈刺，忍者特有的刀法迅捷凌厲，幾番遊走劈砍，卻僅能在厚重鐵板上劃出細碎劃痕，根本難以破防。
糧藏中很快谷塵四起，二人輾轉纏鬥，狹小空間處處皆是磕碰撞擊的鈍響。
望月吉棟是久攻不破，心神本就因城池陷落而瀕臨潰散，幾番閃避已然氣力透支。
扎比•布萊克索恩倒是覷准破綻，戟杆橫磕震飛望月吉棟手中的脇差，趁對方身形失衡踉蹌剎那，十字戟鋒刃徑直貫入胸腹。
沉重戟刃徹底洞穿軀體，望月吉棟的身軀猛地僵住，口中溢位血沫，眼底殘存的決絕不甘緩緩渙散。
扎比•布萊克索恩迅速抽回兵刃，血水順著戟身滴落，砸在滿地穀殼之上。
本欲體面切腹殉城的望月吉棟，終究沒能走完武士最後的儀軌，死於一名異國武者的重甲兵刃之下，死寂糧倉之中，只餘下零落殘血，與城外未曾停歇的戰火轟鳴。
至此，甲賀五十三家筆頭家甲賀望月家覆滅。同時，近江一國全境也因此得以靜謐，以及一度波及山城、攝津、河內、紀伊、和泉、大和、近江、伊賀、伊勢、美濃、播磨、但馬、丹波等近畿諸國的反上杉家國人一揆除了別所家、太田垣家兩家尚未被攻滅，其餘盡數被上杉家彈壓下去。
而先前被六角承禎、六角義治父子留在奧谷城的河端義政、知高左衛門、筧藤之進、犬飼左門、羽甲弦八郎、柊木清吉、黑岩權十郎等仁木家餘孽並沒有像三雲家、甲賀望月家那樣為六角家流盡最後一滴血，反而是在六角承禎、六角義治父子一行人離開後不久，便棄城而逃，意圖經山城前往丹波，去投奔正協助太田垣家于丹波、但馬兩國境目地帶興兵作亂的同族仁木周防守（丹波仁木家庶流）。
雖說河端義政是出自六角家的嫡流，但對近江一國的地理、人文並不是特別熟悉，加上上杉軍的嚴密封鎖，使得他們一行人才迫近甲賀郡與山城綴喜郡境目地帶之時，就被上杉軍細川藤孝部發現。
在窮途末路之下，河端義政一行人並不願意束手就擒，而是紅著眼負隅頑抗，他們並不甘心止步於此，更不甘心就此成為上杉家的階下囚受辱。
可河端義政一行人是陣型散亂、軍心崩碎、以寡敵眾，僅僅一番拼殺過後，盡數被討取，無一人倖免。
之後，作為上杉軍總大將的上杉定虎，並沒有因壓制甲賀郡全境、攻滅六角家而感到高興。她深知上杉家若是沒有收留以扎比•布萊克索恩為首的異國之人，那上杉家在經略近畿諸國的過程絕不可能如此順利和迅速。
受石部城、三雲城、望月城三城守軍的忠義之舉感動，上杉定虎在完成首實檢後，就下令將三城守軍以及周邊遭到兵燹遇難的領民進行收斂安葬，並安排南近江諸郡之中的得道高僧們做法事祈福。
對於布施淡路守、伊佐野上野介、筱山景春、毛枚太郎等六角家降將，上杉定虎看在他們主動縋城而下向上杉軍投降，並告知城中的情況，就赦免了他們，暫時劃歸木下秀吉節制，擔任木下家的與力。
鑑於近江、大和、伊賀、和泉等國的地理位置非常重要，且在戰後不能造成長時間的權力真空，上杉定虎隨後就開始著手使用被主君上杉清定授予的暫定知行權、便宜行事之權，對上杉家新兼併的領地進行相關的人事安排：
雨乞山城城主藤林正保，協助上杉家靜謐伊賀一國有功，加封伊賀阿拜郡田矢城五千石知行地，兼任仁木館城代，伊賀守護代、阿拝郡郡司、伊賀郡郡司等職入故；
小川城城主多羅尾光吉，協助上杉家壓制甲賀郡、攻滅六角家，並討取朝敵六角承禎、六角義治父子有功，加封甲賀郡三雲城一萬石知行地，改任甲賀郡郡司，山城相樂郡郡代入故；
霧山城城主沼田祐光，壓制伊賀一國有功，加封伊勢度會郡三瀨城兩萬石知行地，改任伊勢守護代，山田奉行、大湊奉行以及飯高郡、多氣郡、一志郡、度會郡四郡郡司等職入故；
久居城城主藤田氏邦，在參陣攻略伊賀過程中屢屢立下一番乘、一番槍等戰功，從伊勢一志郡轉封至伊賀山田郡植田城，領有兩萬五千石知行地，並擔任山田郡郡司；
伊勢國司北畠家家宰鳥屋尾滿榮，協助上杉家靜謐大和、伊賀兩國有功，受封大和葛下郡信貴山城，領有兩萬八千石知行地，並擔任葛下郡郡司；
平井城城主木下秀吉，協助靜謐近江，以及及時奪回上杉軍糧草輜重，加封愛知郡鲶江城一萬六千石知行地，並擔任愛知郡郡司；
筒井城城主筒井定慶，因福住順弘、森好之、松倉秀政、島清國等家中重臣們協助上杉家靜謐大和、伊賀兩國有功，加封多聞山城兩萬石知行地，並擔任大和守護代兼添下郡、添上郡、平群郡、廣瀨郡四郡郡司；
柳生城城主柳生宗嚴，協助上杉家靜謐大和、伊賀兩國有功，從大和添上郡轉封至伊賀名張郡比奈知城，領有兩萬五千石知行地，並擔任名張郡郡司；
木津城城主穴澤氏清，協助靜謐大和、伊賀、近江三國有功，加封大和添上郡柳生城七千石知行地，仍擔任綴喜郡郡司、黑雲備軍奉行等職如故；
四手井城城主八戶治義，協助靜謐攝津、和泉有功，從山城宇治郡轉封至大和高市郡貝吹山城，領有三萬五千石知行地，解任宇治郡郡代，改任高市郡郡司；
興福寺大乘院門跡大乘院尋憲，協助上杉家靜謐大和、伊賀兩國，以及為上杉軍籌措糧草輜重有功，擔任興福寺別當；
若江城城主畠山在氏，協助靜謐河內、大和、伊賀三國有功，從河內丹北郡若江城轉封至大和宇智郡今井城，領有兩萬石知行地，解任丹北郡、八上郡、涉川郡三郡郡司，改任河內守護代兼大和吉野郡郡代；
大寶寺城城主三好笑岩，協助靜謐河內、大和、伊賀三國有功，加封大和葛下郡岡城一萬石知行地，並擔任葛下郡郡代；
飯盛山城城主大館晴光，協助靜謐河內、大和、伊賀三國有功，加封讃良郡三個城八千石知行地，仍擔任讃良郡郡司如故；
增地城城代大館義實，協助靜謐伊賀有功，受封伊賀阿拜郡增地城，領有一萬兩千石知行地，仍擔任阿拜郡郡代入故；
多喜山城城主細川藤孝，封鎖甲賀郡境目地帶，以及討取河端義政一行人有功，加封甲賀郡石部城七千石知行地，栗太郡郡代如故；
十市家庶流十市遠長，協助上杉家靜謐大和、伊賀兩國有功，繼承十市家家名，領有三萬四千石知行地，並擔任十市郡郡司；
貝冢寺城城主河田元親，堅守岸和田城，以及協助靜謐和泉有功，加封岸和田城一萬五千石知行地，仍擔任泉南郡郡司如故，中村高次、加地久勝、和久宗是等原松永家家臣作為與力；
藤堂城城主藤堂虎高，協助靜謐近江有功，加封犬上郡久德城七千石知行地，並擔任犬上郡郡代；
肥田城城主金津義舊，堅守肥田城、協助靜謐近江有功，加封犬上郡高宮城七千石知行地，仍擔任犬上郡郡司如故；
佐生城城主後藤高治，協助靜謐近江有功，加封甲賀郡三雲城一萬五千石知行地；
和泉守護細川常元，協助靜謐和泉有功，受封和泉大鳥郡陶器城，領有一萬石知行地；
和泉松浦家家督松浦虎，協助靜謐和泉有功，受封和泉日根郡雨山城，領有兩萬石知行地，並擔任日根郡郡代；
和泉上守護細川家末裔細川政清，協助靜謐和泉有功，受封和泉日根郡高井城，領有一萬石知行地，並擔任日根郡郡司，繼承細川淡路守家家名，遙領淡路津名郡郡司，石津右馬允、井上四郎左衛門尉、大鳥新次郎、成田式部丞等原細川刑部大輔家家臣作為與力；
瀧野城城主大江貞清，協助上杉家靜謐伊賀一國有功，享有本領安堵待遇；
正覺寺、正明寺等伊賀境內一向宗寺院寺領安堵入故；
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不久後，上杉定虎就將仁木館更名為伊賀上野城，以示伊賀境內的府中之地已經易幟。同時，她還於南都奈良設定奈良奉行所（南都奉行所，位於興福寺西北方），受京都所司代管轄，以原伊勢國司北畠家家宰鳥屋尾滿榮為首任奈良奉行，負責警備祭祀、町政司法、管束僧兵與神兵、管控寺領錢糧、嚴防寺院神社私蓄武裝等事務。