萬曆帝沉森森地瞥了申時行一眼，眼裡像填了兩汪黝黑潮寒，
「甘鎮之事，朕前日方見戶科給事中李廷謨題奏上呈，說是西海蒙古諸部皆道宣大貢市不可久，是故部落離心，河西多釁。」
「又彈劾兵部右侍郎兼三邊總督董世彥，泄泄然效薄賞小市之議以求緩目睫，其調度額兵僅僅一千五百名而不精地形。」
「並諫議朕選帥練卒，公賞罰克，先生今日所言，與科道官前日所議，倒是異曲同工。」
申時行回道，
「臣以為，戎兵以安甘鎮，而計之以安河西，昔年世宗庚戌之變，俺答分兵四掠，畿甸大震，實為前車之鑑也。」
萬曆帝冷然一笑，道，
「先生的意思朕明白，薊鎮南兵分立三營，乃昔年先帝所令，譚綸、戚繼光令得專斷，亦是先帝用張居正言，故以兵事所委。」
萬曆帝說到此處，禁不得蔑嗤一聲，道，
「只是先生莫要忘了，昔年俺答之所以能兵臨城下、縱兵大掠，蓋因世宗時有奸逆嚴嵩秉政，嚴嵩為掩其過失，竟令邊關諸將堅壁勿戰，不發一矢，聽憑俺答兵在城外擄掠。」
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「世宗急集兵民，及四方應舉武生守城，並飛檄召諸鎮兵勤王，然大同﹑保定﹑延綏﹑河間﹑宣府﹑山西、遼陽七鎮兵先後至，援軍共五萬餘人卻皆恇怯不敢戰。」
「以致外域之臣，竟敢於世宗跟前坐觀城池，駐兵近郊，而我大明戰守之備一無所有，最終只能宜權許以通貢款虜，世宗在時，一向以此事為奇恥大辱。」
「昔年邊事廢弛，軍餉靡費，而世宗何辜？昔年權奸當政之時，大同、遼東、南京振武營皆生兵變，秣馬厲兵，堅壁清野，而何其難也？」
「如今朕裁汰冗兵，整頓邊務，便是要節制戎政，掣肘邊臣，孔聖人有云：『父在觀其志，父沒觀其行』，倘或九邊重鎮重蹈庚戌虜變之覆轍，先生難道要朕對世宗說一句『三年無改於父之道』麼？」
皇帝的指控嚴重非常，一句「三年無改於父之道」，其言下之意，便是將申時行斥作為世宗之嚴嵩、權逆如張居正。
申時行沉默微頃，最終只得朝皇帝施行一禮，喏喏以應。
申時行這一應，他身後的許國與王錫爵自是更無異議，只是對萬曆帝交口稱讚，頌揚大明武德豐沛。
萬曆帝顏色稍緩，少頃又道，
「先生既說起私軍，朕又想起一事，前幾日兵部上了奏疏，說武弁屬世職，須存留管事加納者，應嚴加考核，若果有勇略，則依其功勞分別敘用，不堪者應革回籍。」
「朕細審其奏，以為兵部分列二款者甚好，請先生復諭其部，朕欲清武弁之濫，從今以後，非系世職武舉，不許領敕行事，或朦朧推升咨用。」
申時行回道，
「吏部近有題奉，今歲乃國家六年一次考察之典，依明例，四品以上官員俱應自陳不職乞賜罷黜以清政本事。」
「皇上若意欲裁革武弁，不如當此記吏之時、朝廷行法之際，計其功能而去留之也。」
萬曆帝道，
「先生此議甚好，朕前日見辛自修奏言，京察關係重大，倘或惟憑台諫銓曹，訪單為據，則往往不免，毀譽出於愛憎，是非半自訛傳，中傷念多，為國念少，以致彼此牴牾公私。」
申時行回道，
「考察事宜自當虛心秉公，皇上可明旨示下，令都察院務必矢心無私，鑑別必求根據，留意必及孤立，然後黨同伐異之風自可銷矣。」
萬曆帝點頭道，
「說起升擢任免，朕這裡卻另有一樁難題，工部尚書楊兆老邁垂朽，工部如今事情又多，石星一人實難堪當工部重任，諸卿以為，何人可替楊兆為工部尚書？」
王錫爵躬身一禮，回道，
「臣以為，工部左侍郎何起鳴可為尚書。」
「臣前日見刑科給事中李國上奏言，先年黃河決堤桃源崔鎮口，與高家堰、黃浦淺諸處、徐邳間俱成巨津，幸賴舊總河臣潘季馴建遙堤、修閘壩、築堰口，導汜濫東歸雲梯關入海，五六年來蓋無水患。」
「頃秋水霪潦橫流，黃河決堤萬家口凡百餘丈，諸臣用力葺塞，稍得緩流，但若春漲波濤洶湧，新塞之口必決，值糧運未過之日，深為可憂。」
「臣聞何起鳴為工部郎中時，嘗往勘黃河故道，施整河工克勤克儉，理當擔此重任，為皇上分憂。」
萬曆帝默然片刻，方道，
「又是潘季馴。」
萬曆帝冷冷道，
「他們都察院為潘季馴鳴冤倒也罷了，畢竟是職責所在。」
「王卿是李植的館師，李植劾以潘季馴黨庇張居正，誣上欺君，朕從其之言，已將潘季馴革職為民，王卿竟也不認同李植所言嗎？」
王錫爵道，
「張居正、馮保之獄，乃皇上志向親定，李植等人不過投皇上所好。」
「皇上一向是知道臣的，從前徐學謨慫恿皇上在太峪山修建壽宮時，李植、江東之及羊可立三人因臣過去曾經駁斥過張居正，故而以喪葬之術、風水之由暗中詆毀首輔，想藉此排斥異己，扶持臣為首輔。」
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「臣當時已上奏疏，陳言『不平者八事』，其中緊要一條，便是諫官言事，當顧國家大體，毋以私滅公，臣聽聞隆慶年間，黃河決堤崔鎮，為運道梗阻，而潘季馴治河以來，民居既奠，河水安流，此皆潘季馴昔年之力也。」
「昔先臣宋禮治會通河，以致河運便利，漕粟益多，利在千秋，而今潘季馴之功不在宋禮之下，臣竊以為，潘季馴罪輕責重，皇上理當為其昭雪。」
王錫爵一席話說完，抬眼朝座上看去，只見萬曆帝正並指捻摁眉心，良久方朝申時行道，
「先生請擬敕旨，升工部左侍郎何起鳴為工部尚書，即日上任，至於河渠歲修，先年漕臣既題有舊例，則著該衙門嚴督所屬，毋得怠弛。」
申時行應了下來，又見萬曆帝放下手道，
「先生可還有要事稟奏？」
申時行忙道，
「還有一事，先蒙欽命，臣等照得重修《大明會典》編纂已完，查得先朝纂修舊例，須有御製序文冠於編首，以垂萬世，臣等謹擬撰序文一通，隨本進呈，請乞聖明裁訓。」
「又查得進書舊例，《實錄》、《會典》於皇極殿進，《玉牒》、《通諡》等書於文華殿進，今次重修《會典》，或於皇極殿，或於文華殿，臣等未敢擅擬，俟有成命，行欽天監擇日，臣等須另具儀進呈，未敢擅便，謹此請旨。」
本是循例裁決之事，萬曆帝一時竟靜默了下來，少頃方開口道，
「朕記得，重修《大明會典》的總裁官，原是張四維罷。」