同時，朱至澍還打算一改舊制，不再讓內閣兼領各部尚書的職務；
徹底將輔佐自己的內閣與主管外庭事務的六部分割開來，形成兩套班子體系，避免一套班子搞一言堂、釀成不可挽回的大錯。
雖然這樣可能會使得內閣權力過小、六部代表的外庭權勢過大，以至於皇權為外庭所壓制；
但只是可能而已，且概率很低。
畢竟自己的制度下，可不會只是六部，而是十幾部、甚至二十幾部都有可能。
這麼多人，是很難抱成團一起壓制皇權的。
除非那個皇帝真就是一個廢中廢。
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若真就是這樣一個廢中廢，那外庭掌控權力也就不是一件壞事了；
起碼可以避免這樣一個廢物葬送了整個國家。
然後，在不讓內閣成員兼領尚書職位、削弱內閣權勢的同時；
朱至澍計劃將此前直屬於自己管理的『四衛』中的督察院、督軍司兩衛拆出來，給到內閣去管理；
同時，還計劃將大理寺（相當於後世最高法）也劃分到內閣；
之後朱至澍還會從刑部將立法權也拆分出來，成立一個類似於後世『司法部』的機構，也交給內閣管理；
如此一來，『三法司』中監察、審判兩個，以及立法權都在內閣。
內閣雖然不再直接管理庶務，但對外庭也具備一定的監管的能力了，不全是一個無實權的秘書機構。
兩套班子也就形成了一種配合中對立的局面，有助於官府內部的自我淨化。
最後，朱至澍還計劃內閣的成員構成中，一半是文臣、一半是武將。
如此，不但可以讓自己在軍事方面更加的得心應手、避免內閣全是一幫不懂軍事的文臣，誤了事；
還可以提高武官的地位，避免後期又出現文臣完全壓制武將、整個國家文恬武嬉、軟綿無力的局面。
想是這樣想，但內閣的設立茲事體大；
尤其是在朱至澍對內閣的職責和人員結構，做了這麼多的改動的情況下，要短時間內將內閣設立起來自然更難。
所以朱至澍只能慢慢籌劃，等登基之後再看具體如何為之。
而在『三辭三讓』這場戲進行中的同時，西南的各項事務也在有序的進行著。
例如戶部和國家資源部的土地清量、人口普查工作；
例如工部的工程和科研工作；
例如禮部的登基大典籌備工作；
例如劉鎮藩的北京城修繕工作；
例如徐墨白的遼東戰事；
例如以吏部領銜的、對應天府的接管工作等等。
雖然朱至澍的登基還有段時間，但對應天府的接管，自然不能夠等到登基之後再去做，不然效率也太差了。
而且如今的應天府，大體上也稱得上是上下歸心、誠心歸附西南；
所以，接管工作已經可以著手安排了。
而要接管，那首先要動起來的就是軍隊。
從山東南下的西南明軍，在接收、安置了在兗州府（今山東棗莊地區）一帶休整已久的史可法和高傑部之後繼續拿下；
著手開始接管、安置應天府『江北四鎮』中、剩餘的劉良佐部和黃得功部；
從河南東進的西南明軍，在接管了開封府之後繼續向東南方向前進；
繼而又接管了徐州、鳳陽府（今安徽宿州、亳州、蚌埠、阜陽一帶）、廬州府（今安徽合肥一帶）；
離應天府也只有三百餘里。
從湖北東進的西南明軍，則接管了九江、南昌等地；
且將繼續東進，往浙江布政使司的金華府、杭州府一帶進發。
從湖南東進的西南明軍，則已經接管了贛州。
從廣西東進的西南明軍，則已經到達了廣州等地......
應天府的大多數重點區域，西南明軍均已經到位；
那些還沒來得及趕到的，也已經是清水灑街、黃土鋪路，等著西南明軍上門了。
此前應天府的一應重臣；
例如九江總督袁繼咸，已經上書成都、請求改任為江西巡撫；
且已經在主動配合從湖北和湖南入贛的西南明軍和官員，對江西的接管了。
湖廣巡撫何騰蛟也是如此；
在上書成都、請求改任為廣東巡撫之後，也已經在主動配合從廣西進入廣東的西南明軍和官員，對廣東的接管。
就連常駐在泉州的鄭芝龍，貌似也都已經完全收起了野心；
除了自請降南安侯為南安伯之外，還搬去了沒有直接靠海的福州，等待著西南使者的到來。
大江南北、形勢都是一片大好。
在各方忙碌中時間過的飛快；
轉眼間的功夫就到了十二月份。
再一次，龍文光領成都群臣於蜀王府前跪呈勸進表。
這已經是第三次了。
而這一次，朱至澍終於沒有再拒絕。
蜀王府正門大開，將龍文光等群臣迎入府中；
龍文光領群臣三跪九叩、誦讀勸進表，請求朱至澍順應天命、體恤民心，登基稱帝、以定天下！
朱至澍只得『勉為其難』的答應，收下了群臣的勸進表。
又兩日，禮部尚書邱晉進言正月初四上合天意、中合六合、下應民心，更適逢太祖登基之日，乃是蜀王登基的上上之選。
群臣附議。
遂定。
朱至澍遂領群臣順江而下、走水路奔赴北京。
與此同時，各布政使知府及以上官員、包括要參加禪讓儀式的朱由崧也開始離境，紛紛向北京城趕去；
而在此之前，大明四方屬國、及其它國家的使臣早已經得到了通知，已經在趕赴北京城的路上了。
速度快的，這時候都已經到北京城了。
好在劉鎮藩的速度也很快；
雖然部分修繕、裝飾等工作還在進行之中，尚未完全完工；
但北京城及周邊治安卻是已經大定、百姓的生活秩序也恢復了正常，不至於在屬國使臣面前失了顏面。
十二月底的時候，緊趕慢趕的朱至澍和群臣終於趕到了北京城。
群臣早已分配好了宅院；
滿清勢力被肅清之後，許多的宅院都空出來了，這些遠道而來的大臣們不用擔心沒有地方安頓。
且不破不立；
經過一番大亂之後、一切都可以推倒重新來過；
資源緊張的北京城，也就可以更加合理的調度分配了。
至於朱至澍自己，則是舉家直接住進了紫禁城！
這也是朱至澍，第一次進紫禁城！