加上上野定行、神吉賴行、神吉吉久（神吉賴定之弟）、神吉三河守等神吉家一門親族眾也對神吉吉安、神吉貞光二人的說辭產生了懷疑，紛紛要求面見神吉賴定。
自知麾下兵力不足，且無法控制局面的神吉吉安、神吉貞光二人在萬般無奈之下，被迫選擇向上杉軍獻出神吉城的大手門，迎上杉軍入城，並前往上杉軍本陣之中請罪。
即便神吉城擁有東之丸、西之丸（真宗寺砦）、二之丸、本丸四座曲輪，以及本丸之中還建有雙重天守閣，依舊無法阻擋如同潮水一般湧入的上杉軍。
加上宇佐美定勝以上杉家常備軍勢左虎捷備一千五百人作為先手役，率先攻入城中。
左虎捷備作為上杉家較早組建的常備軍勢，不僅久經沙場，驍勇善戰，還配置了各式鐵炮五百挺。
在大量鐵炮、弓矢的火力壓制之下，神吉城上下雖有兩千餘守軍，但良莠不齊，裝備簡陋，連一挺鐵炮都沒有裝備。面對上杉軍的火力壓制，箭櫓中、狹間後的守軍被壓制的連頭都抬不起來，根本無法做出有效的反擊，顯得狼狽不堪。
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上野定行、上野次郎父子原本意圖率本部軍勢奪回大手門的控制權，結果才衝出竹束、木楯，就被上杉軍的鐵炮隊打成了篩子，麾下之人也因此戰意全無，做鳥獸散。
等神吉賴行、神吉吉久、神吉三河守等神吉家一門親族眾發現神吉賴定已經遇害後，一名使番就慌慌張張、跌跌撞撞的闖入本丸大廣間之中，將上杉軍已經奪取大手門並攻入城中的訊息告知眾人。
神吉賴行、神吉吉久、神吉三河守等人頓時方寸盡亂，面如土色，驚慌失措，不知守亦不知逃，也拿不出半分對策來。
儘管柏原治郎右衛門、黑田若狹守、中村壹岐守等別所勢諸將仍在堅守二之丸與上杉軍拼死一戰，但兵力寡少，依舊無法扭轉戰局，很快就被占有絕對兵力、裝備優勢的上杉軍擊潰。
柏原治郎右衛門、黑田若狹守、中村壹岐守等人被迫率殘部退入本丸之中，而神吉賴行、神吉三河守、神吉吉久等人更是只能在本丸之中眼睜睜看著守軍節節潰散，東之丸、西之丸、二之丸等曲輪先後陷落，城防也迅速土崩瓦解，徹底陷入亂局。
窮途末路下，神吉賴行、神吉三河守、神吉吉久、柏原治郎右衛門、黑田若狹守、中村壹岐守等人皆知城破兵敗，也無路可退，便不約而同地默然整頓衣甲，齊聚本丸大廣間之中，輪番以切腹自盡。
就這樣，神吉家的復興運動進持續不足半個月，就宣告失敗。
等神吉城陷落的訊息傳至野口城（寺家城）後，城主長井政重（長井長重）是驚懼不已，他自知以四百餘守軍是無力抵禦兵鋒正盛的上杉軍，便一矢不發的直接棄城而逃，將野口城拱手讓給了上杉軍。
橫倉城城主野口新十郎（別所家庶子家野口家家督），見勢不妙，直接將別所就治派來擔任目付的別所家家臣三枝道右（光枝道右）誘殺，連人帶城向上杉軍投降了。
而後，宇佐美定勝還以神吉吉安、神吉貞光、野口新十郎等降將為先導役，乘勝在加古郡、印南郡、美囊郡三郡境內大肆攻城略地。
短短十天之內，上杉軍接連攻落野村城、石守城、國包城、西條城、石野城、法界寺山砦、高木大冢砦等十餘座城池兵砦，還討取別所治之（別所就治四男）、有馬國光、石野氏滿（赤松氏滿，別所家庶子家石野家家督）、高橋平左衛門、小野權左衛門等數名別所家重臣。
如此一來，別所家旗下位於加古郡、印南郡、南美囊郡最外圍的城池兵砦盡數陷落。
雖說宇佐美定勝連戰連捷，兵鋒直指別所家本據三木城（釜山城、別所城），但他就是不輕易對三木城發起猛攻，而是優先拔除三木城外圍的支城兵砦。
畢竟，三木城，北面有美囊川流經，鄰近湯山街道，自古以來就是兵家必爭之地。周邊還有鷹尾山城、三木新城、宮之上要害城、雲龍寺砦、大宮砦等諸多支城兵砦拱衛，可謂是一方有難，八方支援。
故而，宇佐美定勝並不打算在孤軍深入的情況下，貿然對三木城發起猛攻，便派人告知八條廣繁，讓其儘快掃清三木城北面的支城兵砦後，與自己一同對三木城進行圍困，等待八條定繁的後續援軍抵達後，再伺機而動。
顯然，別所就治不會坐視上杉軍徹底將三木城圍困，他一面派遣使者前往鄰近備前境目地帶的利神城，要求庶子家利神別所家家督別所靜治（別所清治）儘快向上杉家舉起反旗，以牽制播磨境內的上杉軍兵力，減輕自己的壓力；一面還親自率軍攻向福井原，阻撓上杉軍構築兵砦。
然而，宇佐美定勝直接來個以逸待勞，他巴不得在野外與別所軍交鋒。他先下令麾下各部軍勢以鐵炮、弓矢對來犯的別所軍進行遠端攻擊。
結果，在上杉軍的鐵炮弓矢的遠端攻勢之下，別所軍在猝不及防之下，是人馬懼驚、陣型大亂。就連別所就治的五男別所治友都在突擊的過程中被當場擊斃，落得個犬死的下場。
別所軍就難以抵擋來自上杉軍的鐵炮、弓矢的遠端攻勢，根本無法迫近上杉軍的陣地。
隨後，宇佐美定勝見時機已至，揮舞著采配，下令左虎捷備的一千名騎馬武士分出兩隊，從左右兩翼對進退失據的別所軍發起衝擊。
本就因上杉軍遠端打擊而混亂不堪的別所軍尚未收攏軍勢，就遭到了上杉軍騎馬武士發起的鉗形攻勢。
在混戰中，上杉軍無不奮勇當先，死戰不退，別所軍則是亂成一團。
還不到一個時辰的功夫，別所軍徹底崩潰，被討取者達到一千餘人，積屍數里，別所就治就連旗印都顧不上帶走，丟棄在福井原。
之後，宇佐美定勝還將原別所家兵砦法界寺山砦、高木大冢砦進行改修加固，並在徵召周邊村落、町鎮的青壯，於高木大山、二位谷、八幡谷、明石道峰、三之谷、小林、君之峰、羽場山、福井原、在田寺等地構築大量兵砦，以切斷三木城南面的一切聯絡。