隨著松永久秀悉心栽培的嫡男松永久通兵敗身亡後，他是悲痛欲絕，執念盡散，心氣消沉，精神也隨之驟然垮掉，進而無心去關注本據信貴山城的城防以及與上杉家的戰事。
可響應近畿諸國反上杉家一方勢力而於山城、攝津等國舉兵的柳本治安、寺町又三郎、木島正家、中井源七郎、柳本新三郎、柳本若狹守、內海久長、山村正次、瓦林足高等京兆細川家舊臣們可不願坐以待斃，他們皆認為是上杉家暗殺了前任京兆細川家家督細川晴元，還覺得上杉家在戰後必然不會對自己網開一面進行赦免，便紛紛請求原足利將軍家奉公眾出身，且與松永久秀關係密切的明智光秀，以及松永宗通（松永久秀次男）、松永孫六郎（松永久秀之侄）、海老名勝正（海老名友清，松永久秀女婿）、森秀光（森正友）、竹內長治（松永久秀女婿，竹內季治庶子）等松永家重臣，應儘快勸諫松永久秀恢復鬥志，振作起來，並指認松永久通之子松永一丸，或讓松永宗通來繼任松永家家督之位，以安人心，同時繼續帶領諸將與上杉家進行抗爭。
但是，松永久秀僅僅只讓明智光秀一人進入本丸的寢殿之中，其餘人等皆拒而不見，哪怕是正室廣橋保子、次男松永宗通、侄子松永孫六郎、長孫松永一丸、女婿竹內長治等至親之人。
等明智光秀緩緩開啟紙門，走進松永久秀的寢殿後，就看到一地的陶瓷碎片。
「松永御史中丞殿，你這又是何意啊？！」明智光秀看著不遠處手持木棍，還在不停打碎茶具的松永久秀後，不解的問道。
「十兵衛，你來了。既然吾兒彥六郎已經於多聞山城兵敗身亡，那麼先前遞交給上杉家的祝言也極有可能被處以極刑，老夫若是留著這些茶具，難道要在信貴山城陷落後，便宜那上條清定嗎？！」聽到明智光秀的聲音，松永久秀才停下了動作，並緩緩轉身後說道。
「聽聞上杉家將新瀨戶燒茶具大量經海路銷往大明、朝鮮等國，獲利頗豐，不太可能會看重松永御史中丞殿所收藏的這些茶具。」明智光秀在聽完松永久秀的話後不禁搖了搖頭，又接著說道，「那位山內左府殿志在一統扶桑五畿七道，並不是玩物喪志之人。若是真能用一些茶具、書畫將其收買，上杉家也就不會有如今這般體量••••••」
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明智光秀可不認為上杉家會渴望奪取松永久秀所收藏的茶具那麼簡單，必然是知曉其鍾愛古天明平蜘蛛釜，以此來測試松永家是否願意獻出古天明平蜘蛛釜來保全家名存續。
「十兵衛，那可不一定。上條清定已經兩度向老夫索要平蜘蛛了。」松永久秀說完就將目光投向了一旁擺放著的古天明平蜘蛛釜，依舊將繼承上杉總領家的上杉清定蔑稱為上條清定，並認為對方意圖將古天明平蜘蛛釜從自己的手中奪走。
「先不說這些，城外的上杉軍數量越來越多，連坐鎮雍州的八條吏部侍郎都糾集攝州、雍州、泉州、紀州等地之兵前來參陣。反觀城中守軍，算上協防領民還不到六千之眾，其中過半之人還是各地潰敗之兵，如何進行抗衡？正所謂明者因時而變，智者隨事而制。」明智光秀。
「十兵衛，老夫自知已到了窮途末路，無法看到三好家、毛利家等友軍的援軍進入和州，更無力為信貴山城解圍。你與老夫不同，是出自濃州土岐家的庶子家，還是原足利將軍家的奉公眾，即便家眷還在上杉家治下領國之中，也依舊沒有遭到上杉家的報復。由此可見，上杉家高層還是很欣賞你的才能。」松永久秀在長嘆一口氣後無奈的說道。
「松永御史中丞殿應振作起來，近畿諸州仍有六角家、仁木家在與上杉家進行抗爭，並為松永家牽制了上杉軍主力，我軍只需堅守至冬季，上杉軍必然會因糧草輜重不濟而被迫退兵。屆時，信貴山城之圍自解。」明智光秀可不認為上杉家能在近畿諸國長期保持近三十萬規模的大軍。
「哼，六角家、仁木家與冢中枯骨無異。十兵衛你別忘了，那上條清定可是在近畿諸州先後調集了近三十萬規模的大軍，即便伊賀眾、甲賀眾再驍勇善戰、神出鬼沒，也無法扭轉不利的局勢，就算他們將上杉軍總大將千秋霜台討取，只怕上杉家方面還會再派遣一員重臣節制大軍，繼續征伐。」松永久秀可不認為損兵折將、丟城失地，且兵羸地蹙的六角家、仁木家能一舉扭轉近畿諸國的局勢，更不認為六角家、仁木家能取下上杉軍總大將上杉定虎的首級。
「松永御史中丞殿何必如此悲觀？！我軍應趁著上杉軍的南蠻大筒運至城下之前，對其進行突襲，否則本就士氣低落的我軍將會被動挨打啊！城外的上杉軍已不下於兩萬之眾！」明智光秀已然領教過上杉軍所裝備重型佛郎機炮的厲害。
「老夫此番是絕不會向上杉家低頭臣從的！上杉家表面上號稱用人不以出身貴賤為準，任人唯賢，可實際上並非如此。老夫所處的和州就是這樣。」松永久秀在頓了頓後又接著說道，「筒井家在被已故長慶公親率大軍攻滅後，餘孽逃入勢州，卻被上杉家扶持，且之後還恢復了一定的舊領，甚至被上杉家配置在老夫的眼底。現任筒井家家督筒井主殿頭根本沒有當主的器量，更無處理政務的能力，反而在上杉家的庇護下成為一方諸侯，就因為筒井家在和州有著較大的影響力，以及曾經作為興福寺旗下官符眾徒的棟樑！」
「松永御史中丞殿說這些又有何意義？！眼下應該考慮如何解圍才是！若真到了不堪再戰的地步，那就應該以茶具來換取城兵、領民的生命，並讓家名存續下去。而在下會伺機率不願降服上杉家的足利將軍家、京兆細川家舊臣渡海前往四國，去出仕義榮公，繼續與上杉家進行抗爭。」明智光秀依舊不願認可上杉家擁立的征夷大將軍、武家棟樑足利義氏。
「十兵衛，老夫也有自己的堅持！」松永久秀目光非常堅毅的說道。
「既然如此，那在下就只好與松永御史中丞殿同進退了。」明智光秀見松永久秀不願再度降服於上杉家的軍門之下，便隨之放棄了渡海逃往四國的想法。
永祿四年，四月二十五日。
當扎比·布萊克索恩率炮隊抵達信貴山城外後，八條定繁隨即下達了攻城的命令。
在重型佛郎機炮的火力支援下，信貴山城外圍的兵砦、箭櫓、多聞櫓（沿石垣橫向延伸，兼具瞭望、射擊與城門防禦功能）等城防設施先後被摧毀。
而後，各部上杉軍層層圍繞信貴山城，攀牒猛攻，殺伐聲不斷。
窮途末路的松永久秀緩緩走出自己的寢殿，憑欄眺望，最後望了一眼大和的土地。
在這片土地上，松永一族曾經為之奮鬥，為之防守，交兵金吾畠山家，抗斗筒井家，如今皆已化為風煙，成為過去。
隨後，松永久秀便又回到自己的寢殿之中，命家臣將火藥堆在寢殿的四周，緩緩拿出原先十河一存使用的脅差若江十河正宗，在明智光秀的介錯下，留下一句「萬事誠然，黃粱一夢」後，切腹自盡。
而明智光秀將松永久秀的首級放置在一個木箱中，就點燃了火藥的引線。
在室外喧擾的交戰聲中，信貴山城還沒能堅持兩個時辰。
就算信貴山城之中也有相當一部分人是要與上杉家抗爭到底，也無法抵擋上杉軍的凌厲攻勢。
西之丸、東之丸、三之丸、出丸等地先後被上杉軍攻落，海老名勝正、森秀光、竹內長治、岩成小次郎（岩成春之之子）、飯田基次、河合秀武、瓦林秀重、瓦林三河守（瓦林總領家家督）、一色秋成、今中光安、高師宣、飯田右兵衛尉、莊村安藝守、⽥村勘三郎、柳本治安、寺町又三郎、木島正家、中井源七郎等松永家重臣、松永家旗下國人領主、原足利將軍家幕臣、原京兆細川家舊臣不是在混戰之中被上杉軍討取，就是切腹自盡。
還沒等上杉軍攻至二之丸，只聽轟的一聲巨響，松永久秀的首級就與其最為鍾愛的茶具古天明平蜘蛛釜一同炸得粉碎。
至於明智光秀，則是在本丸的庭院之中，在沒有人介錯的情況下，含著沒能恢復足利將軍家榮光的遺憾切腹自盡。
先前，因主動從筒井家倒向松永家一方，且被松永久秀信賴，並委以重任的森好久，早在上杉軍兵臨城下之前，就與原主家筒井家暗中進行聯絡，並說服了同為二之丸城番的瓦林長房、瓦林長親兄弟，一矢不發的就將二之丸獻出，並引導上杉軍攻向本丸。
而廣橋保子、松永宗通、松永孫六郎、松永一丸等松永一族之人五十餘人則是聚集於本丸大廣間之中，將大廣間四處點燃後，或是切腹自盡，或是自刎而亡，皆不願成為上杉軍的俘虜而受辱。
就這樣，松永久秀因受三好長慶寵愛和重用才得以將松永家崛起於戰國亂世，且一度成為雄踞一方的大名。但其實力與野心不成正比，以及看不清天下大勢的發展而死於非命，也讓松永家徹底滅亡，且湮沒在歷史的沙塵之中。
原本固守於信貴山城本丸東側多聞櫓的松井康之、荒川治部少輔（松井康之之舅）等人自知無力抵禦上杉軍的凌厲攻勢，便不打算為松永家陪葬，就放棄了負隅頑抗的想法，向攻入本丸的上杉軍投降了。
不過，松永一族並沒有因信貴山城的陷落而徹底絕嗣。
其中，出自入江氏的松永永種，因其祖母松永妙精是松永久秀的伯祖母的緣故，被松永久秀收為養子。在松永久秀正式向上杉家舉起反旗之前，就被松永久秀託付給交情深厚的堺町正直屋店主（老闆）樽井甚左衛門尉。
故而，松永永種才得以僥倖逃出生天。
只是，松永永種可不敢繼續以松永家一門親族眾的身份示人，他直接選擇了輾轉前往丹後，於妙久寺（日蓮宗寺院）剃髮出家，為死於非命的松永一族祈福。
作為松永久秀妹夫的野間長久，早在上杉清定統轄東國大軍發起上洛之役時歸降。其子野間左馬進雖一度成為松永久秀的養子，但松永久秀在向上杉家舉起反旗後，野間長久卻沒有舉兵響應。
松永久秀看在自己妹妹的份上，沒有為難野間左馬進，就與其解除了父子關係，讓他返回了原先的實家野間家。
由於松井康之的身份與一般俘虜不同，不單單是堺町會合眾豪商千利休的弟子之一，茶道高手，且還是主君上杉清定小舅子沼田光長的女婿，更是仁和寺高僧玄圓（松井正之之弟）的侄子。
不僅如此，松井家家祖松井冠者維義之子松井八郎義宗還是足利家的譜代家臣，出仕於足利義清。在足利尊氏成為征夷大將軍、武家棟樑後，松井家的家格也就隨之水漲船高，成為足利將軍家幕臣之一。
松井康之之父松井正之更是先後為足利義晴、足利義輝效力，是足利將軍家的兩朝老臣。於上杉軍攻入京都後，與長男松井勝之在護衛足利義輝的過程中，被上杉軍先後討取。
此後，松井康之因自己的父兄慘死於上杉軍之手，才選擇與以明智光秀為首，且不願降服於上杉家軍門之下的原足利將軍家奉公眾、奉行眾、御部屋眾、御⼩袖御番眾、足輕眾一同行動。
八條定繁就算不看在千利休曾協助自己迅速壓制堺町，且為上杉家賣力籌措糧草輜重的份上，也得給主君上杉清定和一門親族眾沼田光長一些面子的。
所以，八條定繁為了避免與千利休、沼田麝香、沼田光長等人交惡，也不擅自進行處置，而是將松井康之、荒川治部少輔等數名投降的原足利將軍家奉公眾送往上杉家本據小田原城，交由主君上杉清定來進行處置。
至此，大和一國再度獲得靜謐。