木葉十五年忍者之神大限將至。二代影主導的第一次忍界大戰暗潮湧動。為了搜尋行蹤詭譎的斑，千手柱間喚醒了一位戰國時代的感知型忍者。協助千手日向壓制宇智波一族，封印被植入全族萬花筒能力的宇智波光。這位忍者叫日向源。