神保軍衝散了一揆軍後沒有再追擊，即便這些人裡面有照蓮寺的住持，城頭上的僧兵看見一揆軍被衝散，而照蓮寺住持已經撤退，氣勢一下跌到谷底。
而神保家的部隊也已經上城，得到增援力量的守軍再次爆發出一股新力量，僧兵們很快被斬殺殆盡，這些僧兵都是一向宗的狂熱信徒，到死他們依然相信佛祖會保佑他們升往西方極樂世界，因此他們堅持不肯投降。
僧兵們被斬殺殆盡後，鬆了一口氣的守軍氣勢為之一泄，紛紛癱倒在地，神保軍的足輕連忙扶著這些已經奮戰了許久的足輕去休息，神保長職找到了城生城城主。
此刻他正躺在地上大口的喘著粗氣，他強壯的身體上有幾道傷口，不過這些傷口絲毫沒有對他造成影響，看見神保長職來了，他掙扎著就要起身，神保長職連忙走過去將他扶好。
說道「你傷的這麼重，還行什麼禮，趕緊躺好！」城主心裡一暖，神保長職連忙將他扶下，神保長職問道「怎麼樣，傷亡多少？」城主眼中閃過一絲黯淡，說道「具體傷亡我也不知道，不過這次應該十去七八吧！部隊的人數都在我心裡裝著呢！沒想到這次竟然遭受了這麼嚴重的戰損！「
神保長職也嘆了一口氣，然後說道「我給你留下五十名足輕，這是我能夠留下來的最大兵力了，木船城那邊的情況還不知道，不知道竹中久作的大軍攻下木船城了沒有。」
看見神保長職憂心忡忡的樣子，城主寬慰道「家督大人，不要擔心，竹中久作行軍都用了幾天，可見此人的治軍本領實在不怎麼樣，木船城城高兵力雄厚，一定能夠擋住竹中久作的攻擊的！」神保長職知道城主這是安慰他，心中也略微好受了一些，「但願竹中久作名不符實吧！」神保長職心中這樣想到。
木船城，木船城城主已經快要瘋掉了，木船城確實堅固，而且兵力也比較多，有一百二十餘人，可是這幾天來竹中軍就像是發了瘋一樣，拼命的攻擊，木船城現在一共就剩下了二十來人。
木船城城主非常不解，他知道以竹中久作現在的兵力，完全有能力一舉攻下這座城池，但是他們就是不攻擊，只是將眾人圍困在這裡，隨著時間的流逝，木船城守軍的信心正在不斷的減弱，他們不知道自己還能不能活到明天，一時之間，城頭上一片愁雲慘澹。
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九月十六日，神保長職已經帶著部隊趕到了木船城外的郊外，為了查看一下木船城的情況，神保長職沒有立刻向竹中軍發動進攻，而是派出了一批探子，前往前方偵察。
神保軍經過兩次大戰和分兵，現在只剩下了一千一百餘人，所以神保長職必須得偵察，否則他不敢貿然發動進攻。
快要靠近竹中軍營地的一處樹林，兩名身穿黑色胴丸的兩個竹中軍足輕正蹲在這裡解手，這時，一個人影悄悄的來到了他們邊上，其中一名竹中軍足輕大聲說道「治五郎，你拉出來了沒有？」
「還沒有呢？每天吃這些糟糠，哪裡能夠拉的出啊！」名叫治五郎的足輕大聲回應道，「唉！」那名問話的足輕嘆了一口氣，然後說道「是啊！咱們戰無不勝的大軍都在木船城下被阻擋了幾天了，這些木船城的守軍還真是英勇，現在軍中士氣低落，如果神保家的大軍來了，咱們還不知道會怎麼樣呢？」
聞言那名名叫治五郎的足輕也同樣嘆了一口氣，兩個人都沒有再說話，而那個埋伏在不遠處的神保軍偵察兵聽到則是一喜，然後偷偷的移動，繼而向神保軍營地飛快的走過去。
過了好一會兒，那兩個足輕才起身，名叫治五郎的足輕嘿嘿一笑，對旁邊的那名足輕說道「怎麼樣，剛剛我裝的真吧！這下這些探子肯定會被我們麻痹，主公的計劃已經成功一半了！」另一名足輕說道「沒錯，也不看看我們是誰，軍情處啊！那可是咱們主公專門設立的機構，這些人啊！還是太嫩！」
那名神保家的足輕很快趕回了神保軍所在的地方，他立刻趕到了神保長職面前，神保長職看見探子回來了，連忙問道「怎麼樣？有什麼消息嗎？」
探子說道「主公，在下剛剛聽到兩個竹中軍足輕在一邊聊天，從他們聊天的內容看，竹中軍的軍糧已經所剩不多，而且多次攻城均未能拿下木船城，現在竹中軍士氣低落，正是咱們進攻的好時機！」
神保長職沒有說話，這時另外幾名探子夜回來了，神保長職一一向他們問話，得到的結果和剛剛那名探子說的差不多，竹中軍確實是士氣低落，軍糧不多了！
神保長職又召來了軍中的其他幾位將領，幾個人經過一番商議，神保長職決定就於今晚向竹中軍營地發動進攻，他本人親自帶領六百人作為主力從正門攻擊竹中軍營地，其他兩支部隊從西面和南面發動進攻。
天色很快漸漸暗了起來，神保長職有些緊張，為了不暴露目標，他連晚飯都沒有讓眾人吃，神保軍的足輕們只能忍著飢餓感準備到半夜去攻擊竹中軍營地。
又很快到了半夜，整個竹中軍營地的光亮都已經消失，神保長職開始命令部隊開始動起來。
三支部隊向著不同向方向前進，在黑夜裡，這些足輕只能藉助月光來辨別方向。
三支部隊終於趕到了他們的攻擊地點，「上！」三支部隊幾乎同時行動起來，向竹中軍營地衝去，上千人的動靜自然小不了，但是卻沒有竹中軍足輕反應過來，三支部隊很快衝進了營地，他們見人便砍，許多的竹中軍足輕一下被砍倒在地。
但是奇怪的是，並沒有人發出慘叫聲，神保長職覺得奇怪，帶著幾個旗本一下衝進了竹中軍營地中間的那個帳篷，他衝進去一看，卻發現裡面根本就沒有人，神保長職的心一下涼了半截，「快，撤退！」
很快，神保軍足輕的慘叫聲不絕於耳，神保長職劈碎了一塊巨石，帶著身邊的旗本努力的向營門外衝去，不斷的有滾木和巨石滾下來，每一次這些東西都要收割不少的人命，終於過了好一會兒。
這些東西總算是停了下來，然後是一陣喊殺聲響起，無數的竹中軍足輕從四面八方沖了下來，神保長職一下癱坐在地，嘴裡喃喃自語道「完了！全部完了！」
他身邊的足輕努力的將他拉起，帶著他向門外衝去，然而門外已經到處是竹中軍的足輕，而神保軍的部隊被巨石和滾木殺傷了太多，只剩下了幾百人，而且許多人都已經受傷，竹中軍已經將他們包圍。
包圍圈不斷的被拉緊，他們大喊著「繳械不殺！繳械不殺！繳械不殺」神保軍的士氣跌落到了谷底，又許多的神保軍足輕已經經受不住壓力，放下武器，向竹中軍營地走去，忽然，從神保軍人群中衝出來了一個人。
他見人揮刀便砍，一道又一道真氣劈碎了那些想要投降的人的腦袋，那些神保軍足輕嚇的向竹中軍方向瘋狂的逃竄，這時從竹中軍人群中也走出來了一個人，此人正是久作，久作抓住一名正在逃跑的神保軍足輕，問道「他是誰？」手指向神保長職的方向，足輕說道「他是我們家主，神保長職大人！」