一月八日，周六
灰色的光芒閃籠罩的天空下，一個冷漠的聲音傳遞到全世界。
「圖書館那個女人走了，我終於可以看到你悲慘的死狀了，害我浪費四十億年時間的小賊！」
從美洲最高作戰會議室內的總統，屏幕上播出的最新科考隊直播畫面中的每一個成員都一個表情共同說道。
他們在灰色的城市廢墟抓住最近的灰人，人類軍隊原本變成了黑白照片的人中也有從定格成了一張畫的樣子回歸的人。
只是他們卻找不到灰人。
奉風驚覺第一次衝擊後這個已經過了四十億年的世界的每一個人類都是莉莉私，雖然城市裡僅過了兩天，但是外界環境變化再大，他們的祖先也都是一個。
滅世者出手將新的世界觀打入這個世界內重置時間的手段不是為了什麼還原劇情，他改變人類的起源不只是要改一下劇情就行，而是要讓每一個人都成為扣動毀滅的扳機。
原來他到會議室在上首總統一無所知的表情下放下的一支筆被他從頭頂拿下。
滅世者盯著桌上寫著「這個本世紀最大的發現和巨大的商機……」的發言搞諷刺的捧腹大笑。
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「這是人類歷史和超古代文明的聯合的滅亡，這個文明需要一切商品只有滅亡，而我們什麼都有並且能獲得回報，滅世者的回報，哈哈哈……」
十幾人的會議室中重要官員們如同表情一樣的機器人，在奉風閃身走出後，將他各種惡搞的痕跡指出，嘲諷的聲音響徹整個世界。
「啊哈哈你說不用開啟戰爭，不然下次拜訪我將取走你們的頭，傻眼了吧，你取不了了！」
奉風最後掃了一眼總統，明白過來叫石上流的灰人是滅世者安排的人，雖然總統的嘲笑十分刺耳，但是他還是忍不住慶幸自己沒有留下那個背判的灰人。
這時明明沒到時間，他的耳邊卻響起了日語的歌聲。
歌聲繞城不絕，他能傾聽著這首動聽的歌里焦急的音色。
灰城出事了！
「世界は終わりを告げ，灰色……」
奉風聽著夏娃的歌閃回到灰城，見到了城市內除了葛城教授，其一行停滯的身體都活動了起來，並且抓著一個灰人。
在新世紀福音戰士的動漫中，第二次衝擊的場景被描繪為一場毀滅性災難，其影響遠超常規自然事件。
有描寫提到災難發生時，全球海平面驟升，地軸發生扭曲，導致生態系統劇烈變化。
同時，災難引發連鎖反應：沿海城市被淹沒，陸地地貌重組，氣候突變引發極端天氣頻發，全球人口銳減至原先的一半。
原本災難的觸發點常是南極區域。南極研究設施因實驗事故導致使徒暴走，引發能量釋放：天空被漆黑覆蓋，高溫蒸發河水，生物瞬間死亡，地面裂痕蔓延，類似核武器爆炸的視覺與物理效應發生。
如今，第二次衝擊卻發生在了灰城。
火光沖天、煙柱遮蔽天際，地面裂痕中湧出熔岩般的物質，建築物在高溫中坍塌。
巨響伴隨轟鳴聲，持續低頻震動穿透大地，生物哀鳴與機械轟鳴交織。
大氣中懸浮微粒導致能見度驟降，倖存者在廢墟中掙扎，水源被污染，生態系統陷入癱瘓。
人類文明脆弱性與滅世者力量的強大不可控性這麼直白的展現在世人面前。
一個能行動的灰人小隊中五人都僅是底層人員，只是一個技能非常特殊，所以奉風讓這位小隊長帶領隊員在灰域來去自如，做一些雜事。
但是現在萬事都在毀滅，他們並不能總想依靠他們的救命恩人，奉風雖然什麼都辦得到，可是他的那位青梅竹馬也向許表示了奉風大多數時候只是在強撐著而已。
現在他消耗了大量的力量發動灰域，現在這個城市中能行動的不多，這個城市也需要他的力量支撐。
奉風無奈地抬手，卻無法挽回小隊長的勇氣犧牲，他原本就被虛空侵蝕的身體已經好了的身體又一次出現了怪物化的異狀。
虛空病毒，可以發揮出自己的心靈力量，而小隊長的力量是一個麥克風，代表他想大聲吶喊的心靈創傷！
「這一次，我也想陪伴您，一起戰鬥！」
天空中奉風西裝破損的受傷樣子讓小隊長似乎發了瘋一般，那變成怪物之後偏頭的一眼，讓街上僵住的灰人下一秒恢復了正常。
灰人們十分警惕，馬上圍住了小隊長。
「不准動，不然的話我們就殺了你，你的感染情況嚴重，快失控了！」
天空中，滅世者拖著奉風遁於次元壁。
「你還留下了這樣的手下，可惜你要輸了，這個世界上最有價值也是最愚蠢的東西，其實就是這些民眾啊，你予他們疫苗，所以他們承認了你，這份承認力真的很強大很強大。」
「可惜，他們的忠誠卻會讓你的後手失效，害死你，這真是太棒了，哈哈哈！！！！」
看著面前專注前行的奉風，滅世者也諷刺的向前走，並悄悄關注視線範圍之內的小隊長。
他嘴角上揚，滅世者不止要讓奉風任務失敗告終，還要對方在自己給予了恩賜的忠誠手下中敗亡。。
這才是他的報復，可惜總統的身體支撐不了太久了。
通往七層的通道被他重新關閉，是不可能再打開了。
他迫不急待想要看到那個奉風絕望死去的時候了，他不會放任這個讓自己成為失敗者的人，也不會什麼也不做的離開這個世界。
街頭灰人也有一些逃離，只有幾認識小隊長的人留下多次欲言又止，小隊長作為前葬儀社成員卻無法向包圍的眾人說出一句話！
他以為敵人是那位罪惡之王，曾他們曾經的王，那個對他們笑著說會帶他們一起改正這個錯誤的世界，卻最終試圖滅世，與奉風為敵的罪惡之王！
他見帶著的五人小隊推著圍上來的眾人退走了一段距後，大聲響喊。
「敵襲，我先贖罪去了，願迷失之中，希望的燈火永不熄滅！」
「哈哈哈，真是天真又愚蠢！」
隨著響徹整個世界的歌聲，滅世者的嘲諷，第二次衝動在世界各地一齊爆發！