一、地方高層軍政/監察機構
總督
中央派遣到地方的高級軍政長官，常加都察院右都御史銜。
巡撫
中央派遣到地方的高級行政與監察長官，常加都察院右僉都御史銜。
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巡按御史（正七品）
都察院直接派遣，代天子監察地方，可彈劾總督、巡撫等地方大員。
順天府
首都最高行政機關，府尹（正三品）。
應天府
陪都最高行政機關，府尹（正三品）。
二、省行政機關
承宣布政使司（主管民政）
左、右布政使（從二品）——長官
左、右參政（從三品）——分守各道
左、右參議（從四品）——協助參政
提刑按察使司（主管司法、監察）
按察使（正三品）——長官
按察副使（正四品）——分道巡察
僉事（正五品）——分道巡察
三、府、州、縣三級行政
府衙門（主管民政）
知府（正四品）——長官
同知（正五品）——佐貳官
通判（正六品）——佐貳官
推官（正七品）——掌一府刑獄
州衙門
（直接隸屬於省的州為直隸州，隸屬於府的州為屬州）
知州（從五品）——長官
州同知（從六品）——佐貳官
州判官（從七品）——佐貳官
縣衙門
知縣（正七品）——長官
縣丞（正八品）——佐貳官
主簿（正九品）——文書專務
典史（未入流）——負責治安、協助審理