九月中旬，北京城。
隨著兩廣、雲貴的叛亂盡數平定，而福建的鄭芝龍也在鄭成功的勸說下，上奏朝廷主動請求巡視組進駐福建，落實新政、軍改之策，劉衍終於長出了一口氣，隨即召集各部尚書議事，準備料理平亂後的各種首尾。
（由於緩存原因，請用戶直接瀏覽器訪問天天看小說->𝔱𝔱𝔨.𝔱𝔴網站，觀看最快的章節更新）
內閣官署內，各部尚書齊聚一堂，南方的叛亂看上去聲勢浩大，一開始朝野上下也是震動不已，可是卻想不到如此快速的就平定了下去，兩廣、雲貴四省叛軍幾十萬，甚至連一個月都沒堅持到，便被調集的駐防軍平定，可見朝廷的軍改之策是非常有效果的。
劉衍對眾人說道：「今日的第一個議題，便是處置各路叛軍俘虜。」
隨後劉衍對督察部米蒿、公訴部尚書白文議說道：「賊首丁魁楚、李國志、李偉等人均已押解到京，以本公之見，這些賊首全部處以死刑，各部抓捕的俘虜要仔細甄別，凡是主動舉兵的，以及各級將領，都要按照大明律重判！」
「是！」
隨即劉衍對國防部尚書田輝敘說道：「兩廣和雲貴的軍改事宜要立即提上日程。國防部可有具體的方略？」
田輝敘說道：「啟稟閣老，國防部準備以湖廣總兵官李定國部主持貴州道的軍改事宜，以浙江總兵官呂大器部進駐兩廣，主持兩廣軍改事宜，調山東巡撫顏繼祖率部返回山東各地駐防。」
「同時國防部收到了四川總兵官秦良玉的舉薦書，請求朝廷任命黔國公沐天波為雲南總兵官，此事不知閣老以為如何？」
劉衍思索了一下，說道：「如今雲南、貴州、廣西、廣東一下子就空缺了四個總兵官的位子，朝廷也的確需要提拔將領充任。」
「此番平亂，沐天波率部死守昆明城，成功將叛軍調回了雲南府，沒有讓叛軍殺入四川，立下了大功，因功晉升雲南總兵官也是可以的。以本公之見，就這樣安排吧。」
「是。」
劉衍隨後說道：「另外提拔浙江道副總兵李岩為廣西總兵官，調紅娘子一同為廣西總兵府參謀。」
對於這個提拔，田輝敘有不同的意見：「閣老，這李岩的提拔速度是不是快了一些？」
劉衍說道：「如今朝廷正是用人之際，先讓李岩干一段時間，以觀後效吧。」
「是。」
隨即劉衍又提拔了兩人：「提拔黃得功為廣東總兵官，艾能奇為貴州總兵官。」
「湖廣總兵官李定國、參將高傑、劉良佐，浙江總兵官呂大器、四川總兵官秦良玉、副總兵馬祥麟等平亂有功，暫時官職不變，國防部以功勳進行封賞。」
「是。」
隨即田輝敘說道：「還有一事：四川副總兵馬祥麟上報，四川總兵官秦良玉在此番平亂之時積勞成疾，如今病體沉重，怕是不行了。」
劉衍聞訊大驚，臉上不由泛起了一絲悲愴，對眾人說道：「本公不應該讓秦老將軍率軍南下的，是本公害了老將軍！」
眾人紛紛勸解，心中也是很不好受。
秦良玉為維護國家統一、護國安民屢建戰功，為大明的發展與鞏固作出貢獻，是歷史上被單獨載入正史《將相列傳》的巾幗英雄，也是憑戰功封侯的女將軍。
後世女俠秋瑾曾以詩追吊秦良玉：「古今爭傳女狀頭，誰說紅顏不封侯。馬家婦共沈家女，曾有威名振九洲」。
在歷史上，秦良玉活到了1648年才去世，可是因為這場叛亂，秦良玉剛滿七十歲便倒下了，讓劉衍心中如何不自責？
「國防部立即派人前往探視，朝廷也要對秦老將軍進行封賞。如果秦老將軍過世，朝廷要予以國葬，並以其子副總兵馬祥麟繼任四川總兵官。」
「是。」
隨後眾人便開始商議福建的事情。
劉衍說道：「鄭芝龍上奏朝廷，請求朝廷派駐巡視組到福建，指導落實新政、軍改之策。諸位以為如何？」
眾人商議了一會兒，財政部尚書岳明、民政部尚書趙民等人都認為，這是鄭芝龍的緩兵之計，坐擁一省，擁兵二十多萬、戰船數千艘，鄭芝龍會將這些拱手讓給朝廷？
當然，國防部尚書田輝敘、裝備部尚書荀景雲等則認為，在朝廷以摧枯拉朽之勢平定叛亂之後，鄭芝龍肯定已經正視了鄭軍與朝廷之見的差距，在朝廷強大的實力面前，主動投降也不失為明智之舉。
劉衍聽取了雙方的觀點之後，思索了許久，說道：「先讓南方巡視組進駐福建，在福建各地落實新政之策。至於軍改之策的落實，暫緩！」
「鄭芝龍依然為福建都督，任命其子鄭成功為福建總兵官。」
田輝敘說道：「閣老，軍改之策暫緩，那鄭軍的二十多萬大軍怎麼辦？」
劉衍笑著說道：「都說福州城花團錦簇，本公很想親眼見識一下，等到兩廣、雲貴的善後事宜做完，本公將率部前往福建，親自在福建各地落實軍改之策！」
眾人聞言大吃一驚，紛紛站出來反對。
劉衍卻說道：「鄭芝龍不同於其他人，在本公看來，鄭芝龍是與李自成一般的一方梟雄，對於這樣的人，必須要給出足夠的尊重，不可遙控指揮，否則必然無法收其心。」
「另外，福建本公是必須要去一趟的，不光的為了鄭芝龍，還因為本公要巡視那數千艘戰船，這關係到我大明新式水師的籌建大事！」
眾人見劉衍心意已決，雖然心中不同意，但是也無法繼續堅持反對。
只有田輝敘說道：「既然閣老心意已決，也要帶足兵馬才是。」
劉衍點頭答應，自己也不是胡亂逞強，必要的防備還是要有的，畢竟鄭芝龍也不是什麼善男信女，此番低頭，也只是迫於朝廷的強大實力而已。
最後，劉衍便與眾人開始商議兩廣和雲貴文官武將的處置事宜。
「兩廣和雲貴各地的文官武將也全部進行甄別，西南巡視組立即進駐貴州、雲南兩省，在落實新政、軍改的同時，對兩省的文官武將進行甄別，凡是參與叛亂，或是縱容、暗通、失職者，一律免職，交由督察部論處！」
「兩廣的文官武將也是一樣，由朝廷各部調配人手，組建臨時巡視組進駐廣西、廣東兩省。」
劉衍嚴聲說道：「此番要藉此機會，對兩廣、雲貴的官吏進行大換血，同時凡是參與叛亂的地方土司，要一律剷除，所有參與叛亂的土司就地免職，其部眾改為民籍，其地派駐官吏治理。」
民政部尚書趙民領命，隨後說道：「閣老此舉，便是所謂的改土歸流之策吧？」
劉衍點頭說道：「這只是開始，要想在雲貴兩廣之地全面推行改土歸流之策，現在還為時尚早，至少要等到新政、軍改之策完全落實到位之後才行。」
其實劉衍也曾有打算同時在邊疆省份推行改土歸流之策，只是各地土司都有各自的私兵，說白了就是一個有一個縮小版的鄭芝龍，全都在世世代代盤踞在地方，甚至那些少~民都心甘情願的為各自土司效命。
如果朝廷沒有在各地落實新政和軍改之策，就無法加強在地方上的控制力，一旦強行推行改土歸流之策，勢必會造成又一場叛亂，甚至會讓兩廣和雲貴之地狼煙四起，永無寧日，成為朝廷的沉重負擔。
所以劉衍還是決定採取穩妥的辦法，分兩步走，先用新政、軍改之策強力控制地方，然後再推行改土歸流之策。
而此番剷除那些參與叛亂的土司，算是提前預演。有叛亂之罪這個說辭，其他未參與叛亂的土司也說不出什麼來，只會說那些被裁撤的土司是咎由自取。
很快，西南巡視組和臨時巡視組進駐兩廣、雲貴，開始對各地進行整頓，同時數以百計的文官武將被捉拿，兩廣雲貴各地都能見到抄家的兵馬，大批的犯官及家眷被鎖拿回京，大批的錢糧被收繳，除了一部分用於各地重建，以及新政、軍改之策的消耗外，剩下的查抄錢糧全部運回了北京城，由財政部登記入庫。
這場動盪只持續了一個月左右的時間，但是動靜卻非常之大，在劉衍的要求下，朝廷直接藉此機會對兩廣、雲貴的文官武將進行了大清洗，殺死、抄家、判刑者甚眾。
同時，朝廷從北方各省，以及各地新式學校、皇明軍事學院、皇明演武堂的優秀畢業生中，抽調了大量的人才進入兩廣和雲貴為官，基本上將廣東、廣西、雲南、貴州的官吏換了一遍。
轉眼到了十月中旬，劉衍收到參謀部匯總的奏報，得知南方巡視組、臨時巡視組會同各地的駐防軍，對兩廣、雲貴的文官武將進行大清洗，目前已經接近尾聲。
此番共有三十八名犯官直接參與了叛亂，被公訴部判處誅殺三族的判決，還有兩百九十八名犯官被判斬立決，另外有一百一十六人被判刑，七十三人被罷免。
報到朝廷的數字中，此番斬殺的犯官及家眷，還有被殺的俘虜等，一共有一萬三千多人，朝廷抄家所得財物，折合銀幣足有兩千七百餘萬兩。
看到這些數字，劉衍心中依舊怒不可遏，就連雲貴這樣偏遠的省份，都能從官吏家中抄出如此眾多的財物，可見大明原本的吏治腐敗到了何等的地步！
如果不是及時在大明各地落實新政之策，將大明官場的貪腐壓縮在一個可控的程度內，天知道此時的大大明會是一個什麼樣子。
劉衍心中鬆了一口氣的同時，也開始謀劃接下來的福建之行了。
「鄭芝龍所部必須妥善安置，整編為駐防軍顯然是不合適的，看來國防軍的編制又要增加了！」
按照此時大明的軍制，不管是裝備還是軍餉、補給，國防軍都要優於駐防軍。而且即便是同級別的軍官，比如是各總兵官，國防軍的總兵官也要比駐防軍級別高，因為劉衍規定：所有駐防軍的總兵官全都是掛將軍印的，而駐防軍的總兵官則是不掛印。
所以劉衍便考慮將鄭芝龍部兵馬整編為國防軍，以優厚的待遇，將這二十多萬大軍調離福建。
就在劉衍思索具體細節的時候，王承恩卻突然來到內閣官署宣旨。