儘管淨法寺重安、石龜政賴、駒嶺正家、安之平義重等人一度擊退了上杉軍偏師的攻擊，但並不代表他們能迫使上杉軍偏師大將八條房繁就此知難而退。
隨著姊帶城陷落，以及九戶信仲、宮野實富、淨法寺重政、姊帶兼實、夏井久膳、円子光種等人皆兵敗身亡的消息傳入淨法寺城後，頓時給擊退上杉軍偏師進攻、討取上杉家重臣山內舜通的淨法寺城的守將們澆了一盆冷水。
原本，先前見上杉軍勢大而不戰而逃的佐藤正良、浦田光正、大森忠善、有居忠兵衛等淨法寺家重臣們，還打算趁著上杉軍偏師被擊退之際重返各自的舊領，掀起一揆或是對上杉軍小荷馱隊發起襲擾，以此來獲得主家的赦免。
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可沒曾想，二戶郡的形勢卻愈發的糜爛，且難以進行扭轉。
這就使得佐藤正良、浦田光正、大森忠善、有居忠兵衛等人頓時打消了掀起國人一揆，或是襲擾上杉軍小荷馱隊的想法，紛紛尋找與葛卷家、四戶家、七戶家、遠野阿曾沼家等已經倒向上杉家一方的原南部家重臣、旗下國人領主的關係，希望能夠通過他們來換得上杉家授予自己本領安堵的處置。
還沒等淨法寺城的守軍想好下一步該怎麼走時，八條房繁在重整旗鼓後再度軍隊淨法寺城發起猛攻。
作為上杉家同族重臣的八條房繁當然不願見到上杉景信、齋藤朝信等人持續立下戰功，以及急於洗刷被淨法寺勢擊退的恥辱，便節制各部開始對淨法寺城不分晝夜的猛攻。
就在這節骨眼兒上，淨法寺城內部卻突生變故——駒嶺家庶流出身的駒嶺保忠將負責鎮守西之丸的駒嶺正家暗殺，還將大手門獻出。
安田長秀見狀，毫不猶豫的驅使本部軍勢攻入城中。
淨法寺城中的大部分人都不願背棄主家南部家，即便在城池瀕臨陷落的情況下，依舊沒有放棄抵抗，反而在淨法寺重安的率領下，視死如歸的與湧入城中的上杉軍展開混戰，就算是淨法寺家的僕役、侍女等非戰鬥人員也紛紛加入了混戰的行列，一時間血肉橫飛。
因淨法寺城與南部家之間的聯繫已經被切斷，且南部晴政正準備向上杉家舉家降服，使得淨法寺城已經淪落到孤立無援的窘境之中。
最後，上杉軍偏師各部在駒嶺保忠獻出大手門的情況下，依舊用了半天的時間才將淨法寺城攻落，討取自守將淨法寺重安、石龜政賴、駒嶺正家、安之平義重等人以下六百五十餘人。
淨法寺一族之中僅有淨法寺重安之子淨法寺重好在同族重臣淨法寺主膳的拼死護衛下，才得以逃出生天，前去投奔三戶城的南部晴政。
其實，在這時候淨法寺一族的拼死奮戰已經沒有什麼特別大的意義了。因為，南部家很快就要向上杉家舉家降服了。
此時的南部家高層再也沒有一人做出喊打喊殺的主戰論調。畢竟，南部家中極為好戰的九戶信仲、淨法寺重政已經兵敗身亡；石川高信、石龜信房等人被上杉軍圍困在了高水寺城；毛馬內秀范、石鳥谷正友、長牛政義等人正遭到鹿角郡土著國人領主們的圍攻······
可以說，面對極為懸殊的兵力、裝備差距，原本是持中立態度的北信愛、櫻庭光康、東政重、泉山康朝、下斗米家綱等人也發覺與上杉家繼續交鋒是前途渺茫，便轉而支持南長義的主張，認為南部家應儘快向上杉家表明恭順之意，以此來保全南部家的家名存續。
見不少同族、譜代家臣都開始提議向上杉家降服，南部晴政便愈發堅定了舉家降服的政策。
不過，由於上杉定虎所統轄的上杉軍主力已經將二戶郡的絕大部分地區壓制，並從赤松吉時、城守連尹等人手中接收了九戶城，其先陣的上杉景信、齋藤朝信兩部軍勢更是在四戶宗泰的接應下進駐了四戶城之中，距離南部家的本據三戶城已不到二十里，可以說是來到了南部晴政的家門口。
南部晴政在得知這一消息後，已經到了不能不有所表示的地步了。
得益於南長義主動勸說意圖負隅頑抗的一戶城城主一戶政連、目時城城主目時筑前守、晴山城城主晴山忠房（晴山治部少輔之子）等人開城投降，使得上杉軍在迫近二戶郡與三戶郡的境目地帶並沒有遭到什麼抵抗。也讓上杉定虎對南部家恭順表現表示滿意。
在正式前往上杉軍本陣之前，南部晴政還在菩提寺聖壽寺之中剃髮出家，更名為南部入道悅山。
隨後，就帶著北信愛、櫻庭光康、東政重、泉山康朝、下斗米家綱等家中重臣們，以及婿養子南部信直（石川高信長男）、長女鍋姬，一同前往四戶城去參見上杉軍總大將，同時也是上杉清定名代的上杉定虎，並正式請求舉家降伏。
上杉定虎並沒有在四戶城本丸的大廣間裡接見南部晴政一行，反而是在本丸的一處庭園裡。
只見上杉定虎與參陣諸將安坐於走廊上，而南部晴政一行人則是跪拜在庭園的白沙地上，誠惶誠恐，不敢仰視。
其中，南部晴政更是已做好了接受各種羞辱的心理準備，但他聽見的卻是上杉定虎熱情而不失禮貌的招呼：「南部右馬助，為何離得如此之遠？上前一些。」
南部晴政雖然不明就裡，但也只能起身小心翼翼地向前走了幾步。
此時的南部晴政已經剃度落髮，身著一襲黑色的緇衣，手上緊握一串念珠，身上更是冷汗直冒，說話也是戰戰兢兢的：「罪臣南部入道悅山······參見千秋霜台殿，承蒙召見······榮幸之至。」
「南部右馬助免禮，在下已然知曉閣下解除了對四戶領、七戶領、八戶領、淺利領等倒向當家一方的武將治下領地攻擊。若是閣下再晚一步前來，恐怕里見刑部大輔將要率麾下的房總水軍眾於八戶湊登陸了。」上杉定虎一邊打量著南部晴政，一邊說道。