雖說三好備前守、三好備後守等人不顧大局，及時率本部軍勢撤回美馬郡回援，使得香宗我部親泰派出的別動隊沒能將城之坂城、郡里城等地攻落，但他們也沒獲得太多喘息的時間。
當三好郡全境陷落，以及諏訪行成部全軍覆沒的訊息傳來，三好備前守、三好備後守等人就開始如坐針氈了。
毫無疑問，長宗我部元親、一條內基、安宅信康等人所率的土佐上杉軍主力下一個目標不是十河家本據十河城，就是阿波的美馬郡。
比三好備前守、三好備後守等人更加憂慮的是三好義堅，他此時手頭上的可用之兵是捉襟見肘，不僅需要確保十河城、海部城、土佐泊城、勝瑞城、岩倉城、平島御所等重鎮要地不失，還需要準備與攻入阿波的土佐上杉軍主力交鋒。
不僅如此，上杉氏定為了減輕長宗我部元親、西園寺實充、大野利直、一條內基、安宅信康等四國諸將的壓力，還主動赦免了阿波筱原一族，以及細川真之幼子細川之照，並指認細川之照繼承細川讃岐守家家名，指認筱原松滿丸為新一任阿波筱原氏一門總領、阿波筱原家家督，指認筱原自遁為阿波筱原家家督後見役，還命筱原松滿丸、筱原自遁、筱原右近將監、筱原鶴石丸、莊野和泉守、莊野久右衛門等人以及淡路守護代、淡路水軍眾旗頭野口長宗負責護衛細川之照渡海重返阿波，與三好家進行抗爭，且調略阿波、讃岐兩國的有力國人領主們至上杉家一方。
三好義堅為了避免原細川讃岐守家旗下國人領主們倒戈至上杉家一方，便透過足利義榮指認其側近出身的偽御供眾細川宗寅（細川駿河入道宗寅，細川尹賢之弟，細川駿河守家家督）來繼承細川讃岐守家的家名。
可細川宗寅畢竟是細川下野守家庶流出身，不論是與京兆細川家還是細川讃岐守家的血脈皆過於疏遠。導致一宮成實、伊澤俊國、久米義昌等諸多原細川讃岐守家旗下國人領主們強烈不滿。
眼下，三好義堅已然顧不上這些，他深知正值用人之際，以及需要團結家中一切能夠團結的力量，只能暫時不去追究拋棄友軍、丟城失地的三好備前守、三好備後守等人。
還沒等三好義堅做好充分的準備，長宗我部元親在採納其弟香宗我部親泰的建議後，直接沿著吉野川揮師東進，兵鋒直指勝瑞城。
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三好備前守、三好備後守等人自知麾下兵力寡少，便一矢不發的棄城而逃，直接將岩倉城、郡里城、城之坂城等地城池兵砦拱手讓給了上杉軍。
而伊澤城城主伊澤俊國、一宮城城主一宮成實、芝原城城主久米義昌等原細川讃岐守家旗下國人領主們本就與三好家之間有著間隙，加上兩代主君皆死於三好家之手，便紛紛舉兵響應上杉軍的攻勢。
等長宗我部元親率軍抵達中富川一帶，上杉軍已經膨脹至兩萬餘眾。反觀三好義堅，僅僅聚集了六千餘軍勢，且還是良莠不齊、士氣低落。
儘管三好家一方還沒有做好充足的準備，可勝瑞城位於平原之上，很難進行長期堅守。
最終，三好義堅只得硬著頭皮率軍前往中富川與上杉軍展開對峙。
永祿四年，八月二十日。
上杉軍·三好軍對峙於中富川原野，攻守之勢截然分明。
長宗我部元親所率的兩萬餘軍勢軍容嚴整，旌旗連綿數里，步騎相輔、甲冑鮮明。尤其是長宗我部家的一領具足眾更是歷經多年征戰，皆是百戰精銳，士氣高昂。
而三好義堅所率的六千餘軍勢，雖據河川之險，但兵力單薄、軍心惶惶，且三好家底蘊耗盡、外援斷絕，上下多懷怯戰之心，先天處於劣勢。
為求先手，三好義堅便派遣阿波境內武勇無人出其右者的七條兼仲作為先手役，率一千餘軍勢先行渡河探查敵情，於河原地帶列陣試探。
沒曾想，七條兼仲部卻猝然遭遇香宗我部親泰所領三千餘伏兵伏擊，中富川之戰正式打響。
戰事自清晨啟幕，鏖戰終日不息。
即便三好軍依託河岸的陣地進行拼死固守，先陣軍勢還依託地勢頑強阻擊，憑藉熟悉地形的優勢數次發起反撲，一度穩住戰線。
但上杉軍畢竟占有絕對的兵力優勢，加上總大將長宗我部元親排程有度，臨場指揮沉穩凌厲，先是令家中猛將吉良親貞、福留親政等將分別率騎馬武士從兩翼迂迴穿插，切斷三好軍先陣軍勢與本隊的聯絡，再命大量足輕手持三間槍結陣推進，穩步壓縮三好軍的防線。
面對數倍於己的強敵，三好軍雖奮力死戰，奈何兵力懸殊、疲於奔命，防線逐漸崩壞，陣形也節節潰散。
絕境之下，身在本陣的三好義堅再也坐不住了，便決定孤注一擲，親率馬廻眾去突擊上杉軍本陣，意圖擒賊擒王、絕地翻盤。
可長宗我部元親並非泛泛之輩，上杉軍本陣壁壘森嚴，公文重忠、江村親家等長宗我部家重臣率本部軍勢拼死堅守，箭矢如雨、刀槍如林，死死抵住三好軍的決死衝鋒。
幾番猛攻之下，三好義堅不僅未能突破敵陣，麾下馬廻眾死傷慘重，軍心徹底崩潰。
殘陽如血，染紅了滔滔中富川河水，也映得中富川兩岸狼藉的屍身觸目驚心。
三好義堅佇立在敗退的馬背上，一身甲冑沾染泥水與血污，冰冷沉重的鎧甲死死箍著身軀，卻遠不及心口的窒悶刺骨。
耳畔再無昔日軍士震天的吶喊，只剩河水嗚咽、殘卒低低的喘息，方才慘烈廝殺的畫面一遍遍撞碎在眼底——麾下追隨多年的譜代家臣、自幼相隨的武士、誓死效忠計程車卒，未曾敗於怯懦，未曾疏於奮戰，人人皆以血肉之軀死戰不退，最終卻盡數埋骨河灘、血染川流。
三好義堅攥緊韁繩的指節泛白，指骨咔咔作響，眼底翻湧著滔天的不甘與憤懣。非家臣無能，非軍心渙散！他以六千孤師逆勢迎敵，馬廻眾更是人人用命，奮勇衝殺，一度撼動敵軍陣腳。奈何長宗我部元親坐擁兩萬餘大軍，巧用地利水勢，以絕對兵力碾壓合圍，硬生生碾碎了三好軍的陣線。
三好義堅不甘！不甘三好家近百年經營於阿波、讃岐兩國基業，竟毀於此役；不甘一眾忠勇家臣拋頭顱、灑熱血，最終落得全軍折損、屍骨無存的下場；不甘自己守土護民、重振三好家的夙願，一朝破碎，淪為天下群雄的笑柄。
身為三好家的家督，三好義堅眼睜睜看著麾下精銳死傷殆盡，肱骨家臣盡數殞命，親手守護的疆土岌岌可危，卻無力逆轉戰局、保全將士。滔天的無力感裹挾著徹骨的屈辱席捲全身，敗局已定，大勢傾頹，可滿腔熱血與傲骨，從未因慘敗半分折腰。
暮色沉沉，殘兵寥寥。
三好義堅望著血染的中富川，胸中鬱結的悲憤無從宣洩。此戰慘敗，折盡十河精銳，阿波江山風雨飄搖。他心頭只剩無盡憾恨：非戰之罪，乃勢之窮也！今日之敗、將士之殤，此生永世，絕不敢忘！
眼見大勢已去，三好義堅無力回天，只得捨棄殘軍，率少數馬廻眾突圍逃竄，狼狽逃回了勝瑞城。
餘下的三好軍各部見總大將的旗印消失不見後，是群龍無首、四散潰逃、死傷無數，中富川原野屍橫遍野、血染河川。
經此一役，矢上城城主矢野虎村、川人城主川人雅長、下六條城城主三好右衛門、坂東城城主坂東清利、七條城城主七條兼仲、板西城城主赤澤宗傳、保崎城城主馬詰駿河守、西條城城主西條益太夫、北原城城主北原義行、知惠島城城主知惠島重綱、南島城城主甘利奧右衛門、乘島城城主乘島來心、高畠城城主高畠時清、第十城城主第十舍太夫、日開城城主鐮田光義、徳里城城主白鳥左近將監、下浦西城城主田村盤右衛門、鈴江城城主鈴江友明、長鹽城城主長鹽六之進、大寺城城主大寺松太夫、野本城城主野本左近將監、大代城城主大代內匠助、佐藤須賀城城主佐藤長勝、瀨部城城主瀨部友光、高志城城主高志右近將監、大內城城主寒川三河守、宇多津城城主奈良太郎左衛門、新居城城主堀江國正、原城城主原田信綱、香美城城主香美馬之進等阿波、讃岐兩國三好家旗下近四百名有力國人領主、有名武士被討取，三好軍最後的有生力量被殲滅，阿波、讃岐兩國的三好領防線徹底崩塌，殘存勢力再無抵抗之力。
長宗我部元親並不打算給三好家任何喘息之機，趁著大勝之勢，整軍銜尾追擊，徑直揮師圍困勝瑞城。
此時的勝瑞城守軍人心渙散、士氣盡喪、人人自危，經中富川之戰的慘敗早已無死守之志。加上勝瑞城外圍屏障盡失、無援可待，孤城淪為絕地。
長宗我部元親見狀，命大軍四面合圍，晝夜佯攻施壓，以此來瓦解守軍最後的抵抗意志。
短短不到半天的功夫，勝瑞城守軍就徹底崩潰。
福留親政部率先攻破勝瑞城三之丸大手門，如入無人之境。後續的上杉軍各部軍勢也不甘落後，緊隨其後，一舉將這座阿波守護所、原細川讃岐守家本據攻落。
三好義堅根本無力抵擋，只能帶著足利義榮、細川宗寅等人匆忙棄城逃亡，狼狽逃往十河城，也來不及帶上堺公方家、細川讃岐守家的家寶、系圖。
原三好長慶側近出身的藤岡直綱、寺町通昭二人察覺到三好家再無可能中興，便在三好義堅棄城而逃後，並沒有將本丸的府庫燒毀，反而是主動獻出。
由於藤岡直綱、寺町通昭二人擅長防洪治水之名讓長宗我部元親在土佐都有所耳聞，使得他們在向上杉軍投降後還是獲得了長宗我部元親、安宅信康等將的禮遇。
因上杉清定曾重用擅長治水的原三好家淀川川奉行鳥養宗慶，藤岡直綱、寺町通昭二人隨後就表示願意為上杉家效力。
當中富川之戰的結果以及勝瑞城陷落的訊息傳至海部郡後，原本還在躊躇不前的松浦孫八郎是驚懼不已。
也不等松浦孫八郎想好退路，其麾下的三百餘軍勢紛紛開小差逃跑，根本沒人願意繼續為三好家賣命。
最後，岸和田守為了保住自己的小命，便趁著松浦孫八郎、十河了三等人不備，將他們暗殺後，就帶著首級前往勝瑞城，祈求獲得上杉家的赦免。
長宗我部元親本就厭惡賣主求榮之人，他的祖父長宗我部兼序就是被旗下國人領主們背叛而兵敗身亡。
故而，長宗我部元親直接下令將岸和田守斬首示眾，之後還命人將其首級與先前在中富川之戰、勝瑞城之戰討取的首級一併送往攝津芥川山城，交由上杉家少主上杉氏定來進行首實檢。
雖說細川之照在野口長宗的一路護送下成功登陸阿波，但長宗我部元親並不願意見到細川讃岐守家恢復家名，在其沒有正式獲得上杉家或足利將軍家頒下的安堵狀之前，只是將他安置在勝瑞城的二之丸，根本沒有讓其行使權力之意。
而另一方面，就算海部城城主海部吉清成功牽制了土佐上杉軍偏師，沒有讓長宗我部元親的鉗形攻勢奏效，依舊沒能讓局勢得到絲毫的好轉。
就在勝瑞城被攻落的兩天後，北村閒齋、桑名重定、久武左衛門尉等將以三千餘軍勢對海部城發起猛攻，並將其攻落。自海部吉清、惟宗國長、一圓但馬守、安藝千壽丸等人以下三百餘人被盡數討取，無一倖免。
就這樣，依靠木材、海運、砂鐵而崛起的阿波武家名門海部家就此覆滅，阿波一國也隨之靜謐。