朱由檢在接見蘇祿貢使時，提出一個「兄弟之國」的嶄新概念。幾位閣臣一開始還沒醒過味來，過了一會兒才明白了皇帝的意思。文震孟與何如寵立即明確表示反對，畢自嚴與楊嗣昌也委婉地表示這種稱謂似乎不妥，只有王應熊表示支持。
其實王應熊只是因為自己的建議被朱由檢駁斥，正在惶恐之中，故而無論朱由檢說什麼，他都會無條件支持。若究其內心，對「兄弟之國」這種說法也是不以為然的，其他幾位閣臣就更不用說了。在他們看來，大明帝國是當之無愧的天朝上國，四方萬國來朝，定君臣之分才是正理，怎能與番邦稱兄道弟？
朱由檢心裡卻清楚：中國自古以來推行的封貢宗藩羈縻體系，雖然曾經發揮過積極的作用，但隨著地理大發現接近完成，西方列強的觸角已經伸到東亞，這一體系的弊端已經越來越明顯，越來越不利於中國的生存和發展。
首先，是中國的士人階層沉醉於「天朝上國」的地位，不肯「開眼看世界」，而是寧肯採取閉關鎖國的鴕鳥政策，拒不與西方國家來往，從而錯過工業革命的絕好發展良機。♡💣 ❻➈丂ⓗยⓧ.𝓒σ𝓶 💙💝
第二，封貢羈縻體系導致宗主國與藩屬之間的主權與領土問題很不清晰，這對當代國家而言是不可思議的，朱由檢實在無法接受。理論上各藩屬的國王或是首領均應受大明皇帝冊封方才合法，可事實上大明的國力並沒有強大到可以僅憑一句話便更換藩屬國國王的程度，各藩屬國還是自行其是，無形中損害著大明的權威，遠如安南，近如朝鮮，莫不如是。藩屬國與藩屬部落的區別也模糊不清，更沒有明確的邊界劃分，導致甚至沒人能說清大明的疆域到底有多大，邊界到底在哪裡，為後世留下無窮後患。
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第三，宗主國與藩屬國之間的權利與義務嚴重脫節。大明為了維持宗主國的地位，對入貢國採用重金賞賜的手段，對財政而言是個不小的負擔，本身卻並沒有得到什麼實際的好處，只是滿足了皇帝和大臣的虛榮心。而當藩屬國發生戰亂時，大明為了顯示自己宗主國的權威，在調停無效的情況下，如果出兵，則是無償為藩屬國打仗，安南及朝鮮便是如此，往往損兵折將，大傷國力；而如果不出兵，則會嚴重損害自身的權威，藩屬國便會認為大明可欺，搖身一變成為危害大明安全的敵人。💥🎯 ６➈şℍ𝓾ⓧ.ᑕᵒм 👣🍓
所以朱由檢早就想徹底改革這個封貢宗藩羈縻體系了。此次葉爾羌、蘇祿、暹羅入貢，恰好給了他改革的契機。
改革的第一步，就是明確藩屬國與藩屬部落的區別。像葉爾羌，其地本就是中華疆土，這樣的就是藩屬部落，其首領絕不可封汗。基本上東北、西北、西南諸部，全都是藩屬部落，換句話說，他們的地盤全都是大明國土。
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而蘇祿、暹羅等國，中國政權從未延伸到過那裡，朱由檢打算把他們明確為主權國家。既然是主權國家，那和大明之間就不存在君臣、宗藩關係，而是平等的國家關係。如果兩國關係好的話，用「兄弟之國」稱呼便恰如其分了。至於西方各國，更不用問了，都是主權國家。
但是封貢體系已經存在了上千年，如果驟然推翻，別說文震孟等閣臣思想上轉不過彎來，就連蘇祿貢使巴都加蘇里都感到誠惶誠恐，趕緊向朱由檢叩拜道：「我國以臣禮侍奉大明乃是心甘情願，絕不敢與大明平起平坐…」
朱由檢則示意幾位閣臣不要說話，堅定地道：「國有大小之分，而無上下之分。貴國世與大明修好，朕正欲與貴國簽訂盟約，不想貴國已遭兵難。西班牙人亦侵我大明台灣島，為兩國共同之敵，朕出兵相助，理所當然。貴使臣，請你實話實說，貴國還能支撐多久？因為從大明派兵亦需耗費時日。」
巴都加蘇里大喜叩拜道：「只要大明出兵，蘇祿全國軍民誓與紅毛鬼血戰到底！雖然萬分困難，但我王與百姓同甘共苦，百姓亦矢志追隨我王。蘇祿島嶼眾多，叢林茂盛，如紅毛鬼不再增兵，再支撐五到十年尚可。」
「那就好，用不了那麼長時間。」朱由檢頷首道，「大明現有一艘戰艦正在南洋，抵達暹羅後，必有飛鴿傳書至京師。朕接到傳書後，即令該艦先去貴國及呂宋偵察敵情，並將朕之國書轉交貴國國王。鑑於兩國之友好傳統及共御西班牙之時局，朕欲與貴國簽訂友好盟約，請貴國國王細審條款。簽約之後，朕將依約全力援助貴國。大明信義素著，貴使臣且在京師安住，料不日即有傳書來矣。」
巴都加蘇里此行的目的就是來大明搬救兵的，為了能讓大明發兵，蘇祿國王巴都巴沙爾甚至連「奉納版圖」這樣的萬般無奈之策都用上了。沒想到大明皇帝不但口頭應允發兵，而且不但不接受版圖，還提議兩國結成「兄弟之國」，無形中提升了蘇祿國的地位。如果巴都加蘇里有權的話，不管朱由檢提出什麼樣的條約，他都肯定一口答應，因為再苛刻的條約，也比被西班牙滅國或是併入大明版圖要好得多。
至於那些貢品，朱由檢也表示自己不會接受，仍著順天府尹顧炎武主持，以「金牌信符」自由交易。當七大商幫得到消息之後，無不歡呼雀躍，對剩下的八塊信符，更是志在必得，一定要競拍到手。
不過當廷臣們知曉了朱由檢的決定後，不出意外地儘是反對之聲。朱由檢承受的壓力也很大，一方面他要想方設法說服抱著舊思想的官員，另一方面，他也不能不對西班牙人的強勁實力感到擔憂。一旦出兵，能有幾分勝算？此時他真恨不得自己身在「安娜公主」號上，親眼看一看南洋形勢！