「應該是的，我必須帶美洛耶塔離開這裡才行。」
「可是既然這裡被發現了，你們又能夠去哪裡呢？」
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「我和同伴們找到了一個新的地方，我需要帶美洛耶塔過去。」
說著拉里就帶著美洛耶塔走出了別墅，程成和小智幾人也跟了出去。
不過當眾人來到外面之後，就被一陣濃霧給包圍了。
「這是怎麼回事啊？」
「可惡，他們來了，美洛耶塔，我們走。」
拉里準備坐上泥土巨人離開這裡。然而泥土巨人巨人受到了攻擊，向後退了幾步，拉里先生也沒成功登上去。
「是隆隆岩。」
這時，一隻寶可夢出現在了他們的面前。
關都地區的隆隆岩，看來真的是他們來了呀。
這時，一道攻擊再次打了過來。幾人只好躲開來。
緊接著，一隻鐵甲暴龍出現在了他們的面前。
「不好，是鐵甲暴龍！」
從兩隻寶可夢的後面走出了兩個人，他們的衣服上有一個大大的R。
「是火箭隊！」
小智驚訝的說道。
「火箭隊？那是什麼？」
「火箭隊是一群專門利用寶可夢做壞事的人。」
「哼，趕快將美洛耶塔交出來吧，否則我們就不客氣了。」
「休想，泥土巨人，電炮光澤。」
「鐵甲暴龍，破壞光線。」
泥土巨人和鐵甲暴龍打在了一起。
「隆隆岩，滾動攻擊。」
「隨上吧，魔牆人偶，使用障礙。」
程成拿出魔牆人偶，用障礙堆擋住了隆隆岩的攻擊。
「小智，你快帶著美洛耶塔離開這裡吧！」
「可是，拉里先生您怎麼辦？」
「沒關係，我能夠對付的。」
不過這時又有兩個火箭隊的人走了過來。
「小智，你們先走吧，我和沐子會留在這裡幫忙的。」
「好的，那你們小心。」
說著小智三人就離開了這裡。
「沐子，該進行對戰咯。」
「沒問題。」
對方一共有四個人，除了鐵甲暴龍和隆隆岩外，對方又拿出了一隻大嘴蝠和尼多王。
「出來吧，快龍。」
沐子直接拿出了她最強的快龍。程成也沒想到沐子會拿出快龍，這和他的預期有一點不太符合呀。
「快龍，使用龍爪。」
「尼多王，百萬噸拳擊。」
尼多王和快龍打在了一起，程成也就只好選擇對付剩下的隆隆岩和大嘴蝠了。
「出來吧，風鈴鈴。」
「風鈴鈴，大嘴蝠就交給你了。」
「鈴鈴～」
風鈴鈴飛了上去，然後和大嘴蝠開始打了起來。
「隆隆岩，滾動攻擊。」
「魔牆人偶，使用障礙。」
魔牆人偶將障礙斜過來，隆隆岩直接衝上障礙，飛了出去。
既然他們想來，程成就陪他們玩上一會兒。另外一邊，沐子的快龍和對方的尼多王打得平分秋色，而鐵甲暴龍也和泥土巨人打得難分難解。這一場看似十分公平的戰鬥其實存在很多的放水，放水最多的自然就是程成了。
打了十多分鐘之後，火箭隊的人忽然撤退了，程成也就沒有再追擊，而是朝著小智的方向跑去。當程成幾人追上小智的時候，發現這裡只剩下了艾麗絲和天桐。小智和美洛耶塔已經被火箭隊的人抓走了。
「可惡。不行，我們必須將美洛耶塔救回來才行。」
拉里發現美洛耶塔不見了，十分的心急。
「我現在還能夠感覺到小智他們的氣息，他們往那個方向走了，我們趕快追過去吧！」
「你還能感覺到他們的氣息？」
「是的。」
程成現在還隱隱約約的能夠感受到小智他們的氣息。
「那好，我們趕快去追吧！」
程成幾人乘坐寶可夢，然後朝著火箭隊離去的方向追過去。他們一直追到了海上，直到程成感受不到小智他們的氣息。
「他們就在這裡嗎？」
「難道他們在海底？」
這時他們忽然聽到了美洛耶塔的歌聲。
「美洛～美洛美～美洛～美洛～美洛～美洛美洛～美洛～」
「這是美洛耶塔的歌聲，他們絕對就在這附近。可是我們要怎麼成入海底呢？」
「我們先回去吧，找竹蘭小姐商量一下，看看竹蘭小姐有沒有什麼辦法？」程成給大家建議。
「那好吧，我們先回去。」
「眾人回到了竹蘭小姐的別墅。這時，竹蘭小姐接到管家的電話，也立刻回到了這裡。」
「你是說火箭隊的人抓走了美洛耶塔？」
「是的，小智和美洛耶塔他們都被火箭隊的人帶走了。」
「知道他們去哪裡了嗎？」
「知道，他們在一片海域裡，我們知道他們大致的位置。不過在海底，我們根本沒有辦法下去。」
「既然如此，管家，趕快去準備潛艇。」
「是小姐。」
「我們一起去救美洛耶塔和小智他們吧。」
「不過，我擔心的是，火箭隊的人要怎樣利用美洛耶塔的力量呢？他們到底想幹什麼？」
沒過多久，管家就準備了一架潛水遊艇。不得不說，冠軍就是冠軍，遊艇這種東西隨隨便便就拿來了。
「我們趕快走吧。」
眾人乘坐著遊艇，朝著小智所在的海域出發。
當程成一群人來到這片海域時，發現海面上出現了一座島嶼，島嶼像是一座神殿一般。
「這是海底神殿，為什麼會出現在這裡？看來他們已經使用了美洛耶塔的力量。」
「你是說這座神殿的出現是美洛耶塔的力量造成的。」
「是的。在古代的時候，人們和美洛耶塔幸福快樂地生活在一起。不過他們發現了美洛耶塔擁有非常神奇的力量，可以讓他們獲得非常強大的力量。因此他們為了得到美洛耶塔，進行了戰爭。
美洛耶塔不願大家捲入戰爭之中，於是將整座神殿沉入了海中。之後就和我們守護者一族隱藏了起來。沒想到火箭隊的目的竟然也是利用美洛耶塔的力量，我們必須趕快去阻止他們才行。」
這時候，忽然一道能量射向天空，整片天空烏雲密布。程成感受到了熟悉的力量。
「這種力量是？」
「沐子，你也感受到了嗎？」
「是啊，沒想到還能在這裡見到它們。」
「程成，沐子，你們說的是什麼呀？」艾麗絲有些不解。
「艾麗絲，看到這個場景，你沒發現和之前在三雲島發生的事情非常相似嗎？」
「你是說……」
「沒錯，三神雲就要出現了。」
這時天突然從天空中出現了三隻寶可夢，正是雷電雲、暴風雨以及土地雲。
果然是它們，沒想到美洛耶塔的力量竟然能夠將三神雲召喚過來。
沐子也非常的驚訝，她沒想美洛耶塔居然有這麼強大的力量。
這時，一面鏡子忽然飛上了高空，然後停在了三神雲的面前。緊接著鏡面翻轉，三神雲忽然發生了變化。
原本是人形態的三神雲變化成了獸形態，發生了形態的變化。
「它們變化了形態。」
「沒錯，不僅僅是如此。你們沒有發現它們的力量發生了變化嗎？」
「沒錯，它們的力量似乎變得更加的暴躁了。」
「我們趕快過去吧。」
很快幾人就走上了神殿。這時候小智也成功的自我解救出來。
「小智，你沒事吧？」
「我沒事，現在必須將美洛耶塔救出來才行。」
「三神雲，讓我見識一下你們的力量吧！」
忽然，三神雲各自發動了力量，四周的環境發生了變化。天空中閃爍著雷電，大雨和颶風來臨，同時整個海面都結冰了。
「現在三神雲被應該是被坂木控制了，我們必須阻止他們。」
小智看著坂木用鏡子控制著三神雲。
「要想阻止三神雲，我們就必須將美洛耶塔救出來。」
「要救美洛耶塔，必須拖住三神雲才行。」
「那好，小智，你們就去救美洛耶塔吧，三神雲交給我。」
「上吧，烈咬陸鯊。」
竹蘭小姐直接派出了自己的王牌烈咬陸鯊。
「我們也要幫忙。去吧！快龍。」
艾麗絲將自己的快龍派了出來。艾麗絲的快龍也是一隻十分強的寶可夢，比沐子的快龍還要強上一些。
「快龍拜託你了。」
「我們也上吧，泥土巨人。」
三隻寶可夢朝著三神雲衝過去，準備拖住三神雲的戰鬥。
「沐子，我們也去幫忙吧。」
「好呀，上吧快龍。」
「去吧，沙奈朵，月石。」
程成和沐子也派出了自己最強的寶可夢。
六隻寶可夢朝著三神雲飛過去，開始和它們進行戰鬥。
而變化了形態的三神雲比之前爆發的力量還要更加強大，六隻寶可夢配合攻擊，暫時能夠和三神雲進行周旋。不過兩邊的力量完全不在同一個層次，它們堅持不了多久。
「小智，趁現在趕快去救美洛耶塔吧！」
「好，我們走吧，皮卡丘。」
「皮卡。」
「小智，我也和你一起去。」
程成和沐子跟著程成一起爬上了神殿。幾人來到了最上面，看到了坂木和火箭隊。同時還看到了被困住的美洛耶塔。